病原菌-宿主相关数据库BacFITBase


201910月   生物学一区杂志Nucleic Acids Research(核酸研究,IF=11.147)发表了题为BacFITBase: a database to assess the relevance of bacterial genes during host infection”BacFITBase:评估宿主感染期间细菌基因相关性的数据库)论文。

该数据库用于系统鉴定与宿主感染有关的细菌蛋白,旨在鉴定新的抗生素靶标。BacFITBasewww.tartaglialab.com/bacfitbase)包含超过90,000个条目,其中包含有关各种宿主物种在体内感染条件下单个基因对细菌适应性的贡献的信息。数据来自,包括鲍氏不动杆菌(Acinetobacter baumannii)和空肠弯曲菌(Campylobacter jejuni)等最优先的病原体的转座子诱变等15项不同研究。总体而言,BacFITBase包含有关横跨10个不同组织的15种病原细菌和5个宿主脊椎动物的信息。BacFITBase构成了宝贵的资源,可以系统地分类与宿主细胞入侵和感染相关的细菌蛋白。BacFITBase将促进识别目标蛋白质和种间复合物,这将有助于我们了解细菌感染机制,并设计出干扰此类复合物形成的新型抗菌分子。





数据库链接:

www.tartaglialab.com/bacfitbase


参考文献

BacFITBase: a database to assess the relevance of bacterial genes during host infection. Nucleic Acids Research, 2019.

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