简化基因组测序服务包含两种类型建库测序策略,分别为RAD(Restriction Association site DNA)和GBS(Genotyping By Sequencing),两种方法首先都利用限制性核酸内切酶识别基因组相关位点并进行酶切反应,然后对酶切获得的Tag序列进行高通量测序。两者也存在显著区别,GBS由于简化了建库的步骤,所以是一种性价比更高的SNP分型方法,但是获得标记数量显著低于RAD方法。我们可以根据客户研究的特点灵活选用合适的简化基因组方法。
技术参数
RAD | GBS | ddGBS(双酶切) | |
DNA总量 | > 1ug | > 0.5ug | > 0.5ug |
支持内切酶种类 | EcoRI、PstI | EcoRI、PstI | EcoRI,PstI,NlaIII组合 |
测序深度 | 基因组>1X | 基因组>0.5X | 基因组>0.25X |
周期 | 30个工作日,个性化分析需要根据实际情况而定 | ||
适用研究材料 | 所有作图群体、自然群体或者BSA极端混池样品 |