分析模块,计算FASTA格式序列文件中,每一条序列的长度信息。
输入:
FASTA格式的序列数据文件。
示例:
>OTU1
GTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCG ……
>OTU2
GTAGGAATCTTCGGCAATGGACGAAAGTCTGACCGAGCAACGCCG ……
>OTU3
GTGGGGAATATTGGACAATGGGCGAAAGCCTGATCCAGCAATGCCG ……
……
输出:
序列长度信息文件。
示例:
OTU1 425
OTU2 451
OTU3 425
OTU4 430
OTU5 426
其中,第一列为序列名,第二列为序列长度。
关于FASTA格式文件,请参考维基百科:(https://en.wikipedia.org/wiki/FASTA_format)。