热图,运用pheatmap包简单易懂

     不管您是做高通量测序、基因芯片还是蛋白组学、代谢组学研究。热图是文章里常见的图,色彩变化丰富的热图为文章亮色增添不少。热图可以说是生信中最为常见的图形可视化方式,用以展现表达分布模式。

根据我多年的项目研究经验总结,热图一般有两大用途:数据质量控制和展示研究对象的差异变化情况。通过热图,我们能很直观的看到不同分组之间的整体表达模式,因此可以迅速的判断同组之间、各样本间的重复性如何?从而判断实验处理是否正确;数据是否可信可靠符合逻辑。
之前介绍过用MEV绘制热图(热图绘制-MEV软件),今天介绍用R-pheatmap包绘制热图。下面跟着小编一起学习一下吧~~
首先安装及加载pheatmap包
然后按照下面代码进行输入:

输出结果入下图:

转自R语言分析

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