Illumina的高通量SNP芯片是基于Infinium技术的全基因组SNP检测芯片(Infinium™Whole Genome Genotyping),适用于全基因组SNP分型研究及基因拷贝数变化研究,一张芯片可检测几十到几百万标签SNP位点。
技术特点
· 独特的位点选择和设计,采用全世界公认的HapMap数据库中已经公布的TagSNP设计,具有无可比拟的全覆盖优势
· 高重复性和特异性
· 超高的成功率和准确性
· 超高检测通量
实验流程图
芯片产品
人类SNP检测芯片
1. HumanOmni ZhongHua-8:利用来自千人基因组计划的最新内容,覆盖了中国人群中约81%的常见变异(r2> 0.8),其次要等位基因频率(MAF)>5%。对于稀有变异(MAF>2.5%),覆盖了约60%(r2>0.8)。每个样品可检测900015个位点;
2. HumanOmni1-Quad:该款芯片是千人基因组计划可采用的第一个商业产品。可在一张芯片上平行进行四个样品的检测。该款芯片覆盖了已知领域的拷贝数变异(CNV)和已知疾病相关的SNPs,每个样本可以检测一百多万个位点(TagSNP);
3. 人CytoSNP研究芯片(HumanCytoSNP-12):该款芯片的每张chip上可以同时检测12个样本,每个样本可以检测30万个位点(TagSNP);
4. 其他人的SNP芯片产品:HumanOmniExpress、HumanOmni1S、HumanOmni2.5S、HumanOmni2.5-8、HumanOmni5-Quad、Human Exome BeadChip等。
其他物种SNP检测芯片
牛全基因组SNP芯片(Illumina BovineSNP50 Genotyping Beadchip)犬全基因组SNP芯片(Illumina CanineSNP20 Genotyping Beadchip)马全基因组SNP芯片(Illumina EquineSNP50 Genotyping Beadchip)猪全基因组SNP芯片(Illumina PorcineSNP60 Genotyping Beadchip)羊全基因组SNP芯片(Illumina OvineSNP50 Genotyping Beadchip)玉米全基因组SNP芯片(Illumina MaizeSNP50 Genotyping Beadchip)