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——‍Lollipop分析代码‍‍

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棒棒糖图是直观显示蛋白质结构上的突变点最简单且有效的方式。许多致癌基因具有比任何其他基因座更频繁突变的优先位点。这些位点被认为是突变热点，棒棒糖图可以用于显示突变热点以及其他突变位点。并可以对比不同癌症/亚型的突变位点。

基本原理

将蛋白质结构根据氨基酸顺序绘制为长条形，以不同色块标注不同结构域，在基因突变导致氨基酸改变的位置标注棒棒糖，并在棒棒糖圆球标注位点的突变频数以及突变位点。

数据要求

基因突变或者蛋白质突变数据

下游分析

1、突变位点靶向药物分析

2、驱动基因突变分析

图形示例：

图注

不同色块代表不同结构域。棒棒糖标注位点为突变位点，棒棒糖圆球标注数字代表突变频数（如果频数为1则省略）。

应用示例：

1、The whole-genome landscape of medulloblastoma subtypes.（于2017年7月发表在Nature.，影响因子11.878）

髓母细胞瘤亚型的全基因组分析

作者系统性地分析了髓母细胞瘤各个亚型的基因组特征，文中绘制Lollipop图展示了驱动基因的单核苷酸突变情况。

2、Compoundphenotype of osteogenesis imperfecta and Ehlers–Danlos syndromecaused by combined mutations in COL1A1 and COL5A1（于2019年7月发表在Biosci Rep. ，影响因子2.535）

COL1A1及COL5A1组合突变引起的成骨不全症和埃勒斯-当洛二氏综合症复合表型

本文研究了兼有成骨不全症和埃勒斯-当洛二氏综合症患者的COL1A1和COL5A1突变情况，文中绘制Lollipop展示了致病突变在蛋白结构上的位置。