最新全球植物RNA编辑体数据库——《Nucleic Acids Research》

RNA编辑在植物的生长、开花、细胞器发育、应激反应等过程中发挥重要作用。近些年来，大量RNA编辑因子被鉴定出来参与RNA编辑过程，它们会组合成复杂多样的编辑复合体（RNA editosome）并对特异的RNA位点行使编辑功能。虽然已存在几个整合RNA编辑位点信息的数据库，但目前仍缺少系统梳理整合植物RNA编辑因子的专门数据库。基于NCBI下载的总共2651个细胞器数据和注释信息，PED全面整合了RNA编辑因子及相关数据，为研究人员提供关于植物RNA编辑的最新相关信息。

　　目前，PED收录了在8种模式植物（拟南芥、水稻、玉米等）中发现的98个RNA编辑因子，描述信息包括RNA编辑因子注释，编辑因子与编辑位点相互作用，编辑因子对植物功能和表型影响以及详细实验证据等。此外，PED还整理了来自1,621种植物，涵盖1673个植物细胞器的20,836个RNA编辑事件，这些位点分布在203种细胞器基因上。

PED数据库整合及标准化RNA编辑因子，RNA编辑事件及其相互作用等信息，为RNA编辑机制及RNA编辑系统进化研究奠定数据基础。此外，PED配备了界面友好的浏览、查询、筛选和下载功能，用户可以方便地从RNA编辑因子、RNA编辑事件、物种三个角度浏览并下载相关注释信息。总之，PED是研究各种植物的RNA编辑过程的重要资源，对全球植物研究界具有广泛的用途。

参考文献

Plant editosome database: a curated database of RNA editosome in plants. Nucleic Acids Research, 2019.