画树状图

Plot Tree(画树状图)


  分析模块,输入newick-formatted树文件,可由分析模块“Plot Tree using Newick tree format file”生成,根据选定的绘图类型,输出对应的树状图。


  输入:

       1、newick-formatted树文件。

  示例:

(T8:52.08291113,((T5:7.134421288,(T4:6.416415974,T6:6.416415974):0.7180053139):14.99293072,(T7:16.54748754,T9:16.54748754):5.579864468):29.95555911);


       2、样品分组信息表(可选)。

  示例:

T4     group1

T5     group1

T6     group1

T7     group2

T8     group2

T9     group2


  输出:

  树状图。

  示例:phylogram

8.jpg9.jpg

注:如果提供分组文件,那么,同一组内的样品,用同一种颜色标识。



示例:fan

10.jpg


示例: cladogram

11.jpg



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