焦磷酸测序可在一次检测中快速定量一个或多个甲基化位点,是较为理想的验证方法,该技术在表观遗传学研究中逐渐成为数据分析的金标准。
平台基于QIAGEN公司的PyroMark Q96 ID平台,应用焦磷酸测序(Pyrosequencing)技术,不仅解决了常规的焦磷酸测序法在非CpG位点胞嘧啶转化为胸腺嘧啶时影响到引物的结合的问题,进一步提高了结果的准确性;同时,给予的结果除了能准确定性检测到位点变化情况之外,还能精确地计算频率变化。
技术优势
· 先进的算法设计可优化最佳的实验条件,内嵌式的质控保证数据的准确可靠,全程的软件控制减少人为因素的影响
· 灵敏度高,可测到邻近CpG区域的单个甲基化水平
· 周期短、通量高,1h内可同时平行分析96个样本,一次运行可实现多个续CpG位点定量分析
· 对于样品要求低,适用于新鲜、冷冻和FFPE样本
· 对于检测位点要求低,可检测未知序列信息,覆盖到人类基因组的所有CpG位点
· 除常规的检测位点变化情况外,还可准确计算频率变化
服务内容
1. 样本抽提及质检:对客户提供样本进行RNA抽提,并利用NanoDrop进行样本质检;
2. 甲基化检测:根据不同的实验目的,确定合适的检测方法,完成相应的实验;
3. 报告整理:提供包括实验操作流程、原始数据、分析数据在内的详细实验报告。
样品要求
· 样品类型:细胞、新鲜组织或DNA样品
· 样品量:细胞样品请提供至少1×107个细胞,组织样品请提供至少300mg的组织块或切片,DNA样品请提供5 μg以上的DNA
· 样品质量:基因组DNA无明显降解,主带清晰,大于23Kb,无明显弥散。OD260/280值在1.8~2.0之间,浓度 ≥ 500 ng/μl
· 样品保存:细胞样品或新鲜组织块(切成~50mg的小块)可液氮冻存后,-80℃保存。DNA样品可溶于乙醇或超纯水中,-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融
· 样品运输:样品置于1.5 ml冻存管中,封口膜封好,干冰运输
结果展示