数据库|RJunBase：人类组织中RNA剪接数据库

2020年11月，于Nucleic   Acids Research杂志发表题为“RJunBase: a database of RNA splice junctions in human normal and cancerous tissues”文章，介绍整合了人类所有组织中RNA剪切位点数据库——RJunBase。

剪接是多外显子基因RNA加工的重要步骤，能够将内含子从前体RNA中去除，从而产生包含剪接点的成熟RNA。基于高通量测序的方法及其在转录组研究中的应用彻底改变了我们对许多疾病尤其是癌症中RNA剪接的理解。因此，构建整合了所有拼接模式和功能等重要信息，并提供系统注释的公共数据资源已经势在必行。

根据这一目的，作者开发了具有在线分析工具的RJunBase数据库（www.RJunBase.org），收录并描述了从人类所有组织RNA-seq中获得的三种主要的剪接类型，分别为：顺式剪接、反式剪接和融合剪接，涵盖了来自TCGA、GTEx和MiOncoCirc数据库的数据。

数据库旨在帮助用户搜索所需的靶标并获得有关其剪接模式和表达谱的信息，提供了浏览、查询和下载功能，用户可以研究癌组织和正常组织中基因的剪接点，也可以用于肿瘤中特异剪切点的研究。这些功能都有助于研究人员下载完整的数据集，并助力寻找新的与剪接相关的癌症治疗靶标。

图1. RJunBase数据库首页

图2.RJunBase数据库的数据与功能

参考文献

RJunBase: a database of RNA splice junctions inhuman normal and cancerous tissues. Nucleic Acids Research. 2021