根据基因列表得到对应基因的矩阵

Retrieve Rows from matrix/tabular file(根据基因列表得到对应基因的矩阵)


  分析模块,输入矩阵(计数矩阵/FPKM矩阵),和基因名列表文件。根据列表文件提供的基因名信息,提取矩阵中对应基因的行 ,生成只包含输入列表基因名的矩阵。


  输入:

       1、矩阵(Matrix)。

  示例:

   T4    T5    T6    T7    T8    T9

BM590_A0001         565   505   843   286   247   1909

BM590_A0002         362   295   512   124   118   876

BM590_A0003         235   213   333   126   47     1021

BM590_A0004         291   325   447   404   878   1600

BM590_A0005         530   607   848   709   1194         2001

BM590_A0006         456   425   786   287   139   1857

BM590_A0007         21     16     27     1       3       26

BM590_A0008         282   252   425   85     46     843

……


       2、基因名列表文件。

  示例:

BM590_A0001

BM590_A0002

BM590_A0006

BM590_A0007

BM590_A0008

……


  输出:

  矩阵(Matrix),只包含输入基因名列表对应的行。

    示例:

   T4    T5    T6    T7    T8    T9

BM590_A0001         565   505   843   286   247   1909

BM590_A0002         362   295   512   124   118   876

BM590_A0006         456   425   786   287   139   1857

BM590_A0007         21     16     27     1       3       26

BM590_A0008         282   252   425   85     46     843

……


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