Retrieve Rows from matrix/tabular file(根据基因列表得到对应基因的矩阵)
分析模块,输入矩阵(计数矩阵/FPKM矩阵),和基因名列表文件。根据列表文件提供的基因名信息,提取矩阵中对应基因的行 ,生成只包含输入列表基因名的矩阵。
输入:
1、矩阵(Matrix)。
示例:
T4 T5 T6 T7 T8 T9
BM590_A0001 565 505 843 286 247 1909
BM590_A0002 362 295 512 124 118 876
BM590_A0003 235 213 333 126 47 1021
BM590_A0004 291 325 447 404 878 1600
BM590_A0005 530 607 848 709 1194 2001
BM590_A0006 456 425 786 287 139 1857
BM590_A0007 21 16 27 1 3 26
BM590_A0008 282 252 425 85 46 843
……
2、基因名列表文件。
示例:
BM590_A0001
BM590_A0002
BM590_A0006
BM590_A0007
BM590_A0008
……
输出:
矩阵(Matrix),只包含输入基因名列表对应的行。
示例:
T4 T5 T6 T7 T8 T9
BM590_A0001 565 505 843 286 247 1909
BM590_A0002 362 295 512 124 118 876
BM590_A0006 456 425 786 287 139 1857
BM590_A0007 21 16 27 1 3 26
BM590_A0008 282 252 425 85 46 843
……