StarLighter SYBR Green qPCR Mix  (Universal)
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FS-Q1001

StarLighter SYBR Green qPCR Mix (Universal)

100rxn×20μl (1ml)

400

FS-Q1002

StarLighter SYBR Green qPCR Mix (Universal)

125rxn×20μl×4 (1.25ml×4)

1800



产品简述:

StarLighter SYBR Green qPCR Mix是一款含基因工程酶的qPCR试剂。该基因工程酶可耐受高浓度的SYBR Green I染料,反应体系中加入足够多的SYBR Green I 染料,能够降低荧光信号达到阈值的循环数(Ct值),提高信噪比、线性和灵敏度。StarLighter SYBR Green qPCR Mix扩增特异性强,能有效减少非特异性扩增,数据结果更加可靠。产品能有效扩增复杂模板,能有效应对高GC或高AT的目的片段。同时抗抑制剂干扰能力强。

主要应用:

基因表达分析;

低拷贝数基因检测;

基因敲除验证;

基因表达验证;

RNA拷贝数检测(病毒及病菌等检测)。

技术特点:

扩增特异性强,数据结果可靠;

反应效率高,Ct值提前;

信噪比高,灵敏度高;

GC或高AT的片段扩增效果好;

耐受抑制剂能力强。

优异表现:

(1)扩增特异性强,数据结果可靠

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Fig1

以人的cDNA为模板,使用引物ApoE及不同厂家试剂,扩增长度为322bp的片段, GC%=75.5%(高GC),分别得到StarLighter SYBR Green qPCR Mix与各竞品的扩增和熔解曲线图;

qPCR反应后产物的电泳图。

注:SL-StarLighterSYBR Green qPCR Mix,使用此试剂得到非常完美的扩增曲线,荧光信号强,熔解曲线及电泳条带单一、准确。

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Fig2

以人的cDNA为模板,使用引物TR及不同厂家试剂,扩增长度为219bp的片段, GC%=64%,分别得到StarLighter SYBR Green qPCR Mix与各竞品的扩增和熔解曲线图;

qPCR反应后产物的电泳图。

注:SL-StarLighterSYBR Green qPCR Mix,其余代表不同竞品。使用启衡星试剂得到非常完美的扩增曲线,荧光信号强,熔解曲线及电泳条带单一、准确。

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Fig3

以人的cDNA为模板,使用引物UBC及不同厂家试剂,扩增长度为123bp的片段, GC%=52.0%(GC 均衡),分别得到StarLighter SYBR Green qPCR Mix与各竞品的扩增和熔解曲线图;

qPCR反应后产物的电泳图。

注:SL-StarLighterSYBR Green qPCR Mix,其余代表不同竞品。使用启衡星试剂得到非常完美的扩增曲线,荧光信号强,熔解曲线及电泳条带单一、准确。

总结Fig1Fig2Fig3如下图(SLStarLighter SYBR Green qPCR Mix):

 Primer

竞品

ApoE(人,DNAamplicon length=322bp, GC%=75%

TR(人,DNAamplicon

length=219bp, GC%=64.0%

UBC(人,cDNAamplicon length=123bp, GC%=52.0%

特异产物

扩增效率

特异产物

扩增效率

特异产物

扩增效率

TG

149.631%

96.795%



TK





102.101%

VZ



97.196%



AB





98.789%

TY3



98.028%

110.361%

KA



108.63%



SL

105.049%

95.998%

100.374%

YS





99.905%

CW







BR





95.611%

RC



92.762%

97.752%

TY1





96.83%

(2)扩增效率高,梯度稀释线性范围好,低拷贝检测灵敏度高

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Fig4

KAPA Ion Torrent Library Quantification Kit 中浓度为8.3pM 的标准品作为S1,依次5倍稀释得到(S2-S10)为模板,StarLighter SYBR Green qPCR Mix与竞品KP的扩增及熔解曲线图。

StarLighter SYBR Green qPCR Mix,从S1-S10,扩增效率(Eff=100.483%)好,扩增曲线完美,荧光信号强,熔解曲线单一峰,无非特异性扩增。

(3)荧光信号强,灵敏度高

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Fig5:

使用市面上个品牌的qPCR试剂得到扩增曲线图,上图为去掉ROX后,各品牌的荧光信号值比较,竞品KPStarLighter SYBR Green qPCR Mix的荧光信号强度最高。

(4)Ct值提早出现

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Fig6

以人DNA为模板,使用引物TR及不同厂家试剂,扩增长度为219bp的片段,GC%=64%;在产物经电泳验证为目的片段的前提下,扩增曲线去Rox校正后,StarLighter SYBR Green qPCR Mix CT值最小(灵敏度最高)。

5)高GC或高AT的片段扩增效果好

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Fig7

以人的DNA为模板,使用引物F8-exon10及不同厂家试剂,扩增长度为399bp的片段,GC%=35.6%;从扩增效率上看, StarLighter SYBR Green qPCR Mix Eff=94.365%为最优,竞品TY3Eff=121.91%,竞品KPEff=NA(最高浓度无扩增)。

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Fig8

以人的DNA为模板,使用引物hPRT1及不同厂家试剂,扩增长度为198bp的片段,GC%=35.6%;从扩增效率上看, StarLighter SYBR Green qPCR Mix Eff=100.868%为最优,竞品TY3Eff=94.630%,竞品KPEff=98.334%

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Fig9

以人的DNA为模板,使用引物β-actin及不同厂家试剂,扩增长度为290bp的片段,GC%=61.0%;从扩增效率上看, StarLighter SYBR Green qPCR Mix Eff=102.101%为最优,竞品TY3Eff=110.787%,竞品KPEff= NA(最高浓度无扩

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Fig10

以人的DNA为模板,使用引物ApoE及不同厂家试剂,扩增长度为322bp的片段,GC%=75.5%;从扩增效率上看, StarLighter SYBR Green qPCR Mix Eff=101.307%为最优,竞品TY3Eff=150.097%,竞品KPEff= NA(最高浓度无扩增)。

6)耐受抑制剂能力强

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Fig11

以人的DNA为模板,使用引物F8-exon10及不同厂家试剂,扩增长度为393bp的片段,GC%=35.6%;从扩增效率上看, StarLighter SYBR Green qPCR Mix Eff=94.365%为最优,竞品TY3Eff=121.91%,竞品KPEff= NA(最高浓度无扩增)。

以天根磁珠法血液基因组提取试剂盒提取的DNA为模板,原始模板浓度为100ng/μl,使用10mM Tris(含0.05%吐温-20)稀释2倍后作为S1,之后依次使用同样稀释液按梯度稀释10倍分别得到S2S3S4StarLighter SYBR Green qPCR Mix扩增效率符合要求,竞品TY3及竞品KPS1模板扩增均受到不同程度的抑制。

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Fig12

以人的DNA为模板,使用引物ApoE及不同厂家试剂,扩增长度为322bp的片段,GC%=75.5%;从扩增效率上看, StarLighter SYBR Green qPCR Mix Eff=101.307%为最优,竞品TY3Eff=150.097%,竞品KPEff= NA(最高浓度无扩增)。

以天根磁珠法血液基因组提取试剂盒提取的DNA为模板,原始模板浓度为100ng/μl,使用10mM Tris(含0.05%吐温-20)稀释2倍后作为S1,之后依次使用同样稀释液按梯度稀释10倍分别得到S2S3S4StarLighter SYBR Green qPCR Mix扩增效率符合要求,竞品TY3及竞品KPS1模板扩增均受到不同程度的抑制。

7)保存稳定性

7.14℃保存稳定性

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Fig13

以人的DNA为模板,使用引物UBC,扩增长度为123bp的片段,GC%=52%;从扩增曲线上可以看出,4℃储存最多达39天时,未见明显信号强度降低和Ct值延迟。

7.2、常温与37℃保存稳定性

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Fig14

以人的DNA为模板,使用引物UBC,扩增长度为123bp的片段,GC%=52%;从扩增曲线上可以看出,常温或37℃储存最多达8天时,未见明显信号强度降低和Ct值延迟。

7.3、冻融稳定性

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Fig15

以人的DNA为模板,使用引物UBC,扩增长度为123bp的片段,GC%=52%;从扩增曲线上可以看出,冻融次数最多达35次,未见明显信号强度降低和Ct值延迟。

7.17.27.3实验结果均出自ABI7500 Fast机器,使用Fast模式,程序为95℃5min40cycles95℃30sec60℃45sec),加熔解曲线。

7.4、不同机型/程序稳定性

1)使用ABI QuantStudio6 Flex

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Fig16

如上图,使用引物ApoE,扩增长度为322bp的片段, GC%=75.5%;扩增体系与反应程序同7.17.27.3,默认升温1.9℃/s,降温1.6℃/s。从扩增及熔解曲线上可以看出,扩增产物特异性很好,Eff=99%.

2)使用ABI 7500 FAST STANDARD 模式


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Fig17:                                                       

如上图,使用引物TR,扩增长度为219bp的片段, GC%=64%;       

从扩增及熔解曲线上可以看出,扩增产物特异性很好,Eff=103%.

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Fig18

如上图,使用引物hPRT1,扩增长度为198bp的片段, GC%=37%

从扩增及熔解曲线上可以看出,扩增产物特异性很好,Eff=95%

定量反应(体系、程序参数)

1)推荐反应体系

组分

10 µl /rxn

20 µl /rxn

终浓度

H2OPCR级)

补至10µl

补至20µl

N/A

2× SYBR qPCR Ready Mix

5μl

10μl

1x

10 µM 正向引物   

0.3 μl

0.6 μl

300 nM   

10 µM 反向引物   

0.3 μl

0.6 μl

300 nM   

cDNA模板

<50ng/μl

<50ng/μl

根据需要

RoX

0.2μl

0.4μl

50/500nM(根据仪器需要)

2)推荐反应程序

步骤

温度

时间

循环

酶激活

95℃

5 min


变性

95℃

30 sec

40 cycles

退火/延伸 数据采集

60℃

≥20 sec(根据仪器和扩增产物长度;若采用三步法,20sec退火后,72℃延伸1sec

熔解曲线

根据仪器要求

说明书附件下载:

 StarLighter SYBR Green qPCR Mix说明书V1.pdf



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