Agilent人类表达谱芯片参加了美国FDA组织实施的MAQC计划,系列指标表现突出,综合性能极佳,展示了其喷墨原位合成技术的实力。除了基于该技术的多物种的成品芯片外,Agilent着力发展个性化解决方案,利用其e-Array设计软件,可以灵活迅速地根据客户要求为客户设计制作各种芯片产品。
Agilent 芯片特点
· 独特的喷墨原位合成技术;
· 探针长度60mer,可以兼顾灵敏性和特异性,使二者达到良好的平衡;
· 由于采取长探针设计,有利于捕捉对生命活动有重要意义的低丰度基因;
· 芯片随数据库及时更新,基因信息更新更全,可最早升级到最新芯片版本;
· 灵活的定制方案,仅需基因组或EST序列,客户即可任意制作自己的芯片;
· 平均CV<10%(MAQC:Nature Biotechnology Sept,2006);
· 芯片具有良好的可重复性,相关系数R2>0.95(MAQC);
· 芯片数据结果与qPCR数据结果具有良好的相关性,相关系数R2>0.9(MAQC )。
Agilent表达谱芯片种类
Agilent表达谱芯片服务 | |
模式生物 | 人、大鼠、小鼠、线虫、果蝇、斑马鱼、非洲爪蟾、水稻、拟南芥、大肠杆菌、酵母 |
动物 | 人、大鼠、小鼠、线虫、果蝇、鸡、狗、猪、马、牛、家兔、绵羊、恒河猴、斑马鱼、疟蚊、非洲爪蟾、三文鱼 |
植物 | 水稻、拟南芥、小麦、大麦、棉花、烟草、芸苔、番茄、苜蓿 |
微生物 | 大肠杆菌、稻瘟病菌、酵母 |
Agilent芯片检测流程
芯片分析流程
芯片名称:Agilent SurePrint G3 Human Gene Expression 8x60K v2 Microarray NEW!
芯片介绍:安捷伦基于G3平台最新设计的人类表达谱芯片,将编码和非编码RNA整合在单张芯片上。除检测30,000条Entrez Gene RNAs外,还涵盖了12,000条lincRNAs。该芯片可同时检测蛋白编码RNA和非编码RNA的表达量变化。通过分析二者之间的相互关系,有助于预测lincRNA生物学功能。探针设计参照的数据库为:RefSeqBuild36.3;EnsembleRelease 52;Unigene Build 216;GenBank (April 2009)。lincRNA探针是Agilent和John Rinn 实验室(麻省理工学院-哈佛大学Broad研究所)共同设计的。
芯片名称:Agilent SurePrint G3 Human Gene Expression 8x60K Microarray
芯片介绍:Agilent的人全基因组表达谱芯片,检测同时编码和非编码RNA,涵盖27,958条Entrez GeneRNA和7,419l条LincRNAs。设计该产品所用的序列信息源于对RefSeq、Goldenpath、Ensembl和Unigene等知名数据库的深入研究,并与人类基因组拼接进行比对。绝大多数探针经过Agilent专利的实验验证程序的检验和优化。
芯片名称:Agilent Whole Human Genome Gene Expression 4x44K v2 Microarray
芯片介绍:Agilent的人全基因组表达谱芯片,包含27,958条EntrezGeneRNA。序列信息源于:RefSeq、Goldenpath、Ensembl和Unigene 。