Get Sequences from fasta file(fasta序列提取)
分析模块输入fasta格式的序列文件,和序列ID列表文件,输出列表文件中指定ID信息的序列。
输入:
1、fasta格式的序列文件:
>OTU1
GTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGCCTGATCCAGCCATGCCGCGTGA ……
>OTU2
GTAGGGAATCTTCGGCAATGGACGAAAGTCTGACCGAGCAACGCCGCGTG ……
……
2、表格文件:
OTU ID 10 11 12
OTU3 3212 1769 7230
OTU4 4143 2548 2328
……
指定ID信息所在的列数为:1。
输出:
对应ID信息的序列文件:
> OTU3
GTGGGGAATATTGGACAATGGGCGCAAGC……
> OTU4
GTAGGGAATCTTCGGCAATGGACGAAAGT……
……