Plot groups rarefaction curves(分组均值稀释性曲线)
分析模块根据,稀释性曲线模块的数值计算结果文件(html格式,可由分析模块 "Plot samples rarefaction curves" 生成),或者Shannon-Wiener曲线模块的数值计算结果文件(html格式,可由分析模块"Plot Shannon-Wiener rarefaction curves" 生成),结合分组信息文件中的分组信息。分析模块计算同组样品内,所有个体的平均值和标准差,并按组为单位进行作图。适合于样品数特别多的情况下,按组进行可视化作图。
输入:
1、稀释性曲线模块的数值计算结果文件(html格式,可由分析模块 "Plot samples rarefaction curves"生成),或者Shannon-Wiener曲线模块的数值计算结果文件(html格式,可由分析模块 "Plot Shannon-Wiener rarefaction curves" 生成)。
2、样品分组信息表:
Bio1 group1
Bio2 group1
Bio3 group1
Bio4 group2
Bio5 group2
Bio6 group2
Bio7 group2
Bio8 group3
Bio9 group3
Bio10 group3
输出:
各分组稀释性曲线图或各分组Shannon Wiener曲线图。
注:横坐标:随机抽取的测序数据量;纵坐标:该分组内所有样品,对应观测到的OTU数量的平均值。图中竖线对应均值按标准差上下浮动后的结果。
注:横坐标:随机抽取的测序数据量;纵坐标:该分组内所有样品,对应的Shannon多样性指数的平均值。图中竖线对应均值按标准差上下浮动后的结果。