Leading with leaders

Mix2 (Mix-Square)通过RNA-Seq数据中的位置覆盖偏差，来准确计算出基因isoform的丰度。使用Mix2进行isoform定量是可重复跨变量条件的，并可准确检测差异表达。

优势：

l 准确评估转录本浓度；

l 不同测序设备、文库制备和各种降解类型RNA，丰度评测的结果都可重复；

l 准确检测差异表达；

l 可以对RNA测序中的数据偏差类型进行检测并归类；

l 运算速度超快，且占用内存小。

工作原理：

RNA测序中isoform定量的准确性和重复性，受RNA测序数据中的片段偏差的影响。Mix2没有对覆盖偏差做出任何假设，而是将混合模型与每个基因的isoform数据进行拟合（Fig.1）。因此，Mix2可以准确地表现5'偏差，如Fig. 1（A和B）所示，而Cufflinks软件仅限于均匀分布（Fig. 1C）。

Figure 1 | Mix²的工作原理。