案例分享一
阿勒颇松(P.halepensis)在干旱胁迫及恢复过程中的转录组分析
研究内容:
森林树种会采用各自的策略应对自然环境中的干旱胁迫,其中阿勒颇松作为分布广泛的高耐旱性松树树种之一,其抵御干旱胁迫的机制备受研究者关注。本研究重点关注阿勒颇松在干旱胁迫及恢复过程中转录组的动态变化,从转录组水平探索其耐旱及恢复的分子机制。
研究结论:
本研究中发现了约6000个与干旱及恢复相关的差异表达转录本,聚类结果显示胁迫造成的表达下调主要存在于光合作用、气孔活性、黄酮及萜类化合物生物合成、脂肪酸及细胞壁的生物合成等过程。上调表达包括叶绿素降解、AsA独立巯基介导的ROS清除,脱落酸响应和热休克蛋白,索马甜和苏氨酸的积累过程。基于植物生理组和转录组研究,揭示了阿勒颇松耐旱及恢复的动态响应过程和分子机制。
参考文献:
Transcriptome analysis of Pinus halepensis under drought stress and during recovery. Tree Physiology, 2017.
案例分享二
番茄DELLA蛋白(PROCERA,以下简称PRO)在保卫细胞中促进气孔闭合
植物一般多采用闭合气孔或减缓生长的策略来应对缺水可能造成的损伤,有研究表明生长促进激素赤霉素(GA)水平的降低能够增加植物的缺水耐受性,但机制不明。本研究针对GA信号的负控蛋白DELLA蛋白PRO对番茄的缺水耐受性影响展开讨论,提出了DELLA蛋白促进植物耐缺水胁迫机制的假设模型。
研究结论:
DELLA蛋白PRO可以通过增加脱落酸(ABA)敏感性来促进气孔闭合、减少水分流失以应对缺水胁迫,pro突变会导致功能缺失,相比于正常株,会造成缺水环境下气孔导度相对较高,水分快速流失,而过表达DELLA(S-della)则可有效应对缺水环境。在短暂缺水情况下,GA生物合成受到抑制,会造成DELLA积累,后者直接或间接促进ABA受体基因的转录。ABA受体基因表达的增加可能导致细胞的ABA敏感性增强,进而导致气孔迅速关闭。在长期干旱情况下,GA水平低,DELLA积累到高水平,导致植物生长收受到抑制。
参考文献:
The tomato DELLA protein PROCERA acts in guard cells to promote stomatal closure.Plant Cell,2017.
案例分享三
豇豆应对土壤干旱胁迫的自然变异和基因调控基础
豇豆(Vigna unguiculata ssp. sesquipedalis)是非洲原产的抗旱豆科植物,本研究中重点关注不同基因型芦笋豆应对干旱胁迫的遗传变异,选取95株已开展分型研究的中国豇豆样本,探索不同基因型与耐旱表型之间的相关关系。
研究结论:
基于GWAS分析,发现39个与抗旱性相关的SNP位点,通过比较四种基因型作物之间全株植物的水分关系,发现对土壤水分含量的不同敏感性是水源配置的基因型特异性反应的重要机制,不同的基因型有各自用对气候变化的适应性机制,而相关SNP标记的鉴定为分子辅助育种提供了有价值的信息。
参考文献:
Natural variation and gene regulatory basis for the responses of asparagus beans to soil drought. Frontiers in plant sciences, 2015.