网页版超好用神器，外科医生也能用3分钟分析RNA-seq了！WGCNA也能顺手做

来欣赏一波进化版的网页神器吧，首先看下大体长啥样：

这就是基本的界面了，非常简洁干净。下面进行操作演示了，由于操作都是一样的，于是就直接选用单细胞测序数据进行测试了：

然后咱们点击提交，具体时间要看你的数据量，数据量小的相对比较快，然后就进入了第二个分析界面，以及它所能完成的一系列秀操作了。

好，下面开始正式秀操作了，包括样本相关性聚类图，PCA， MDS,以及最近非常流行的 tSNE，热图流行好久了，还有聚类，因为根本不需要多余的动作，点进去就能看。

样本相关性聚类图

tSNE

流行很久的热图

某种不知名算法的聚类，具体细节就不多说了，感觉用的不是特别多，但是图还挺酷的：

好，下面要敲黑板了！ WGCNA这种比较高级的分析，直接用网页工具点击做。

WGCNA的样本聚类图

WGCNA基因模块

还有一个很漂亮的图，一般会放在论文里的，可以直接下载哈;

接下来的功能就是差异基因分析了，这个大家比较常规了，也大体展示下能得到哪些结果，操作绝对是简单得不能再简单了。

下面坐等收获成果了，小样本比较快的。

基本上到此为止，一套常规的分析就完成了，学习成本非常之低了!越来越多的网络轻工具在降低我们常规分析的门槛，帮助无生物信息背景的小伙伴分析数据，毕竟RNA-seq这样的技术方法已经飞入百姓家了。

本神器芳名IRIS-EDA（http://bmbl.sdstate.edu/IRIS/），关于本网页版神器的学术论文发表在 PLoS Comput Biol 杂志。

附上参考文献：

MonierB, McDermaid A, Wang C, Zhao J, Miller A, Fennell A, et al. (2019) IRIS-EDA: An integrated RNA-Seqinterpretation system for gene expression data analysis. PLoS Comput Biol15(2): e1006792.