简化基因组甲基化测序（RRBS）——高性价比的甲基化测序方案

产品介绍

简化基因组甲基化测序（Reduced Representation Bisulfite Sequencing, RRBS）是通过限制性酶切的方法，富集基因组DNA上CCGG位点的片段，经Bisulfite处理和高通量测序技术，进行基因组CpG富集区域内的单碱基分辨率的甲基化测序。相对WGBS而言，RRBS技术是一种高性价比的甲基化测序方案，广泛适用于动物物种的甲基化研究，哺乳动物RRBS测序可以检测到高达0.5M以上CpG位点。

技术路线

样本要求

基因组DNA：>=2ug

样品浓度>30ng/ul; 无RNA和蛋白污染

建库测序

测序策略：Illumina HiSeq, PE150

测序深度：10G

标准化分析

1.原始数据去除低质量、去除接头污染处理

2、测序reads长度统计

3、数据处理后质量评估

4、测序数据基因组比对

5、测序数据BS转化率评估

6、酶切效率分析

7、基因组测序深度和覆盖度分析

8、胞嘧啶（C）甲基化水平计算

9、胞嘧啶甲基化状态评估

10、甲基化胞嘧啶（mC）临近区域（9bp）序列特征分析

11、CG、CHG和CHH的凭据甲基化水平

12、各基因组元件中CG、CHG和CHH的平均甲基化水平

13、不同基因组元件上的甲基化水平分布特征

14、不同基因结构元件上的甲基化水平分布特征

15、差异甲基化区域（DMRs）检测

16、差异甲基化区域（DMRs）的位置及相关基因注释

17、差异甲基化区域（DMRs）相关基因的GP富集分析

18、差异甲基化区域（DMRs）相关基因的KEGG富集分析

高级分析

19、多样性间基因组尺度甲基化水平聚类分析

20、多样本间基因组尺度甲基化水平主成份分析（PCA）

21、疾病相关甲基化分析和功能预测

22、多组学整合关联分析（需其他组学数据，如转录组数据）

23、其他定制化分析

项目周期

45个工作日