组学样本量

RNA组学样本需求

 

表达谱

/miRNA

芯片

RNA-seq

miRNA/

small

RNA-seq

lncRNA

/ circRNA

/ceRNA

原核转录

组测序

宏转录

组

动物组织
≥500mg
 
 
植物组织
≥1g
 
 
细胞
≥5*10^5-6 个
 
 
全血(非肝素钠抗凝)

3ml收集白细胞/2.5mlPAXgene管保存

(配套Qiagen指定试剂盒抽提)

 
 
菌体
≥10^8 个
≥10^9 个
≥10^9 个
≥10^9 个
≥10^10个
≥10^10个
血清
≥1ml
 
 
 
 
 
血浆
≥1ml
 
 
 
 
 
RNA
≥500ng
≥2000ng
≥2000ng
≥2000ng
≥10000ng
≥5000ng
石蜡切片(10μm)
≥250 mm2*10片
≥250 mm2*10
无
≥250 mm2*10
 
 
单细胞
 
单个或微量保存在特定裂解液中
 
 
 
 


DNA 组学样本需求

 

DNA芯片

/简化基因组

(甲基化/SNP)

WGS

(全基因组)

MeDIP-seq

(甲基化组)

WES

(外显子组)

Chip-seq

(免疫共沉淀)

动物组织
≥50mg
≥100mg
≥100mg
≥100mg
 
植物组织
≥2g
2-8g
2-8g
2-8g
 
细胞
≥10^6 个
 

全血

(非肝素

钠抗凝)

≥500µL
 
菌体
≥10^8 个
≥10^9 个
≥10^9 个
 
 
血清
2mL
2mL
2mL
 
 
血浆
2mL
2mL
2mL
10mL
 
石蜡切片(10μm)
≥250 mm2*10片
≥250 mm2*10片
 
≥250 mm2*10片
 
DNA
1-2μg
≥2μg
≥5μg
≥2μg
≥30ng



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