组学样本量

RNA组学样本需求

 

表达谱

/miRNA

芯片

RNA-seq

miRNA/

small

RNA-seq

lncRNA

/ circRNA

/ceRNA

原核转录

测序

转录

动物组织
500mg
 
 
植物组织
1g
 
 
细胞
≥5*10^5-6
 
 
全血(非肝素钠抗凝)

3ml收集白细胞/2.5mlPAXgene管保存

(配套Qiagen指定试剂盒抽提)

 
 
菌体
≥10^8
10^9
≥10^9
≥10^9
10^10
10^10
血清
≥1ml
 
 
 
 
 
血浆
≥1ml
 
 
 
 
 
RNA
≥500ng
2000ng
2000ng
2000ng
≥10000ng
5000ng
石蜡切片(10μm
≥250 mm2*10
≥250 mm2*10
≥250 mm2*10
 
 
单细胞
 
单个或微量保存在特定裂解液中
 
 
 
 


DNA 组学样本需求

 

DNA芯片

/简化基因组

(甲基化/SNP

WGS

(全基因组)

MeDIP-seq

(甲基化组)

WES

(外显子组)

Chip-seq

(免疫共沉淀)

动物组织
50mg
≥100mg
≥100mg
≥100mg
 
植物组织
≥2g
2-8g
2-8g
2-8g
 
细胞
≥10^6
 

全血

(非肝素

钠抗凝)

≥500µL
 
菌体
≥10^8
≥10^9
≥10^9
 
 
血清
2mL
2mL
2mL
 
 
血浆
2mL
2mL
2mL
10mL
 
石蜡切片(10μm
≥250 mm2*10
≥250 mm2*10
 
≥250 mm2*10
 
DNA
1-2μg
≥2μg
≥5μg
≥2μg
≥30ng



分享