GEO目前收录的单细胞研究样本已经超过2万例,单细胞测序几乎成为生物医学领域CNS优秀文章的标配。实验费用高昂,阻断了CNS梦,既然其他数据可以挖,单细胞测序数据照样可以挖。
已知公共数据库中单细胞测序数据涉及各种疾病类型,包括肿瘤、免疫细胞、炎症类甚至神经、肌肉、骨骼等,样本丰富、数据庞大,你不挖就是失去了一座金山。我们提供各种设计单细胞测序、各种测序、芯片、多组学的公共数据库挖掘、培训、模型构建、临床统计、算法还原服务;你能想到,我能做到;你提供参考文献、思路和目的,我们提供结果;如果没有思路,我们提供付费科研设计服务。
示例如下:利用公共数据库的1539个单细胞样本,构建自己的生物学故事。
基于GEO的单细胞测序数据发现了具有不同分化特征的胶质母细胞瘤(GBM)细胞,继而进行差异表达分析找到分化相关的基因(GDRG),最后根据这些基因构建分子分型与预后预测模型。简单粗暴有效。