StarLighter SYBR Green qPCR Mix  (Universal)
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FS-Q1001

StarLighter SYBR Green qPCR Mix (Universal)

100rxn×20μl (1ml)

400

FS-Q1002

StarLighter SYBR Green qPCR Mix (Universal)

125rxn×20μl×4 (1.25ml×4)

1800



产品简述:

StarLighter SYBR Green qPCR Mix是一款含基因工程酶的qPCR试剂。该基因工程酶可耐受高浓度的SYBR Green I染料,反应体系中加入足够多的SYBR Green I 染料,能够降低荧光信号达到阈值的循环数(Ct值),提高信噪比、线性和灵敏度。StarLighter SYBR Green qPCR Mix扩增特异性强,能有效减少非特异性扩增,数据结果更加可靠。产品能有效扩增复杂模板,能有效应对高GC或高AT的目的片段。同时抗抑制剂干扰能力强。

主要应用:

基因表达分析;

低拷贝数基因检测;

基因敲除验证;

基因表达验证;

RNA拷贝数检测(病毒及病菌等检测)。

技术特点:

扩增特异性强,数据结果可靠;

反应效率高,Ct值提前;

信噪比高,灵敏度高;

高GC或高AT的片段扩增效果好;

耐受抑制剂能力强。

优异表现:

(1)扩增特异性强,数据结果可靠

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Fig1:

以人的cDNA为模板,使用引物ApoE及不同厂家试剂,扩增长度为322bp的片段, GC%=75.5%(高GC),分别得到StarLighter SYBR Green qPCR Mix与各竞品的扩增和熔解曲线图;

为qPCR反应后产物的电泳图。

注:SL-StarLighterSYBR Green qPCR Mix,使用此试剂得到非常完美的扩增曲线,荧光信号强,熔解曲线及电泳条带单一、准确。

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5.jpg

Fig2:

以人的cDNA为模板,使用引物TR及不同厂家试剂,扩增长度为219bp的片段, GC%=64%,分别得到StarLighter SYBR Green qPCR Mix与各竞品的扩增和熔解曲线图;

为qPCR反应后产物的电泳图。

注:SL-StarLighterSYBR Green qPCR Mix,其余代表不同竞品。使用启衡星试剂得到非常完美的扩增曲线,荧光信号强,熔解曲线及电泳条带单一、准确。

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6.2.jpg

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Fig3:

以人的cDNA为模板,使用引物UBC及不同厂家试剂,扩增长度为123bp的片段, GC%=52.0%(GC 均衡),分别得到StarLighter SYBR Green qPCR Mix与各竞品的扩增和熔解曲线图;

为qPCR反应后产物的电泳图。

注:SL-StarLighterSYBR Green qPCR Mix,其余代表不同竞品。使用启衡星试剂得到非常完美的扩增曲线,荧光信号强,熔解曲线及电泳条带单一、准确。

总结Fig1、Fig2、Fig3如下图(SL为StarLighter SYBR Green qPCR Mix):

 Primer

竞品

ApoE(人,DNA,amplicon length=322bp, GC%=75%)

TR(人,DNA,amplicon

length=219bp, GC%=64.0%)

UBC(人,cDNA,amplicon length=123bp, GC%=52.0%)

特异产物

扩增效率

特异产物

扩增效率

特异产物

扩增效率

TG

√

149.631%

√

96.795%



TK





√

102.101%

VZ



√

97.196%



AB





√

98.789%

TY3



√

98.028%

√

110.361%

KA



√

108.63%



SL

√

105.049%

√

95.998%

√

100.374%

YS





√

99.905%

CW







BR





√

95.611%

RC



√

92.762%

√

97.752%

TY1





√

96.83%

(2)扩增效率高,梯度稀释线性范围好,低拷贝检测灵敏度高

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Fig4:

以KAPA Ion Torrent Library Quantification Kit 中浓度为8.3pM 的标准品作为S1,依次5倍稀释得到(S2-S10)为模板,StarLighter SYBR Green qPCR Mix与竞品KP的扩增及熔解曲线图。

StarLighter SYBR Green qPCR Mix,从S1-S10,扩增效率(Eff=100.483%)好,扩增曲线完美,荧光信号强,熔解曲线单一峰,无非特异性扩增。

(3)荧光信号强,灵敏度高

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Fig5:

使用市面上个品牌的qPCR试剂得到扩增曲线图,上图为去掉ROX后,各品牌的荧光信号值比较,竞品KP与StarLighter SYBR Green qPCR Mix的荧光信号强度最高。

(4)Ct值提早出现

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Fig6:

以人DNA为模板,使用引物TR及不同厂家试剂,扩增长度为219bp的片段,GC%=64%;在产物经电泳验证为目的片段的前提下,扩增曲线去Rox校正后,StarLighter SYBR Green qPCR Mix CT值最小(灵敏度最高)。

(5)高GC或高AT的片段扩增效果好

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Fig7:

以人的DNA为模板,使用引物F8-exon10及不同厂家试剂,扩增长度为399bp的片段,GC%=35.6%;从扩增效率上看, StarLighter SYBR Green qPCR Mix ,Eff=94.365%为最优,竞品TY3,Eff=121.91%,竞品KP,Eff=NA(最高浓度无扩增)。

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Fig8:

以人的DNA为模板,使用引物hPRT1及不同厂家试剂,扩增长度为198bp的片段,GC%=35.6%;从扩增效率上看, StarLighter SYBR Green qPCR Mix ,Eff=100.868%为最优,竞品TY3,Eff=94.630%,竞品KP,Eff=98.334%。

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Fig9:

以人的DNA为模板,使用引物β-actin及不同厂家试剂,扩增长度为290bp的片段,GC%=61.0%;从扩增效率上看, StarLighter SYBR Green qPCR Mix ,Eff=102.101%为最优,竞品TY3,Eff=110.787%,竞品KP,Eff= NA(最高浓度无扩

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Fig10:

以人的DNA为模板,使用引物ApoE及不同厂家试剂,扩增长度为322bp的片段,GC%=75.5%;从扩增效率上看, StarLighter SYBR Green qPCR Mix ,Eff=101.307%为最优,竞品TY3,Eff=150.097%,竞品KP,Eff= NA(最高浓度无扩增)。

(6)耐受抑制剂能力强

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Fig11:

以人的DNA为模板,使用引物F8-exon10及不同厂家试剂,扩增长度为393bp的片段,GC%=35.6%;从扩增效率上看, StarLighter SYBR Green qPCR Mix ,Eff=94.365%为最优,竞品TY3,Eff=121.91%,竞品KP,Eff= NA(最高浓度无扩增)。

以天根磁珠法血液基因组提取试剂盒提取的DNA为模板,原始模板浓度为100ng/μl,使用10mM Tris(含0.05%吐温-20)稀释2倍后作为S1,之后依次使用同样稀释液按梯度稀释10倍分别得到S2、S3、S4。StarLighter SYBR Green qPCR Mix扩增效率符合要求,竞品TY3及竞品KP的S1模板扩增均受到不同程度的抑制。

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Fig12:

以人的DNA为模板,使用引物ApoE及不同厂家试剂,扩增长度为322bp的片段,GC%=75.5%;从扩增效率上看, StarLighter SYBR Green qPCR Mix ,Eff=101.307%为最优,竞品TY3,Eff=150.097%,竞品KP,Eff= NA(最高浓度无扩增)。

以天根磁珠法血液基因组提取试剂盒提取的DNA为模板,原始模板浓度为100ng/μl,使用10mM Tris(含0.05%吐温-20)稀释2倍后作为S1,之后依次使用同样稀释液按梯度稀释10倍分别得到S2、S3、S4。StarLighter SYBR Green qPCR Mix扩增效率符合要求,竞品TY3及竞品KP的S1模板扩增均受到不同程度的抑制。

(7)保存稳定性

7.1、4℃保存稳定性

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Fig13:

以人的DNA为模板,使用引物UBC,扩增长度为123bp的片段,GC%=52%;从扩增曲线上可以看出,4℃储存最多达39天时,未见明显信号强度降低和Ct值延迟。

7.2、常温与37℃保存稳定性

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Fig14:

以人的DNA为模板,使用引物UBC,扩增长度为123bp的片段,GC%=52%;从扩增曲线上可以看出,常温或37℃储存最多达8天时,未见明显信号强度降低和Ct值延迟。

7.3、冻融稳定性

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Fig15:

以人的DNA为模板,使用引物UBC,扩增长度为123bp的片段,GC%=52%;从扩增曲线上可以看出,冻融次数最多达35次,未见明显信号强度降低和Ct值延迟。

7.1、7.2、7.3实验结果均出自ABI7500 Fast机器,使用Fast模式,程序为95℃、5min,40cycles(95℃、30sec,60℃、45sec),加熔解曲线。

7.4、不同机型/程序稳定性

(1)使用ABI QuantStudio6 Flex

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Fig16:

如上图,使用引物ApoE,扩增长度为322bp的片段, GC%=75.5%;扩增体系与反应程序同7.1、7.2、7.3,默认升温1.9℃/s,降温1.6℃/s。从扩增及熔解曲线上可以看出,扩增产物特异性很好,Eff=99%.

(2)使用ABI 7500 FAST STANDARD 模式


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Fig17:                                                       

如上图,使用引物TR,扩增长度为219bp的片段, GC%=64%;       

从扩增及熔解曲线上可以看出,扩增产物特异性很好,Eff=103%.

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Fig18:

如上图,使用引物hPRT1,扩增长度为198bp的片段, GC%=37%;

从扩增及熔解曲线上可以看出,扩增产物特异性很好,Eff=95%

定量反应(体系、程序参数)

(1)推荐反应体系

组分

10 µl /rxn

20 µl /rxn

终浓度

H2O(PCR级)

补至10µl

补至20µl

N/A

2× SYBR qPCR Ready Mix

5μl

10μl

1x

10 µM 正向引物   

0.3 μl

0.6 μl

300 nM   

10 µM 反向引物   

0.3 μl

0.6 μl

300 nM   

cDNA模板

(<50ng/μl)

(<50ng/μl)

根据需要

RoX

0.2μl

0.4μl

50/500nM(根据仪器需要)

(2)推荐反应程序

步骤

温度

时间

循环

酶激活

95℃

5 min


变性

95℃

30 sec

40 cycles

退火/延伸 数据采集

60℃

≥20 sec(根据仪器和扩增产物长度;若采用三步法,20sec退火后,72℃延伸1sec)

熔解曲线

根据仪器要求

说明书附件下载:

 StarLighter SYBR Green qPCR Mix说明书V1.pdf



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