云生物生存曲线软件说明文档

1.选择分析模式:

2. 选用已有TCGA数据:

a) 在Windows系统下创建文本文档，第一行第一列填写GeneID，默认表头，默认第二行开始为基因列表，每一行为一个基因名称，点击回车键ENTER依次输入其他基因列表（见下图），保存关闭，命名为GeneID.txt。也可以通过excel表格另存为文本文档。

b) 找到文件位置选择:

c) 输入基因所在列号,本例中填写1

d) 选择TCGA肿瘤类型,如BRCA乳腺癌

e) 输入按基因表达值的百分之多少进行分组,如按中值输入50,表示50%. 该设置只在最佳cutoff选择否时起作用. 当选择使用最优cutoff时,忽略该输入.

f) 选择输出的目录:

g) 每个基因得到两种形式的生存曲线图:时间轴默认为day。

3. 选择自定义模式:

和TCGA已有模式类似, 但还需要指定表达文件和生存信息文件的位置,以及选择生存状态和时间的所在列数

扫码申请获取进阶教程