Leading with leaders

circos

circos图通过圆圈和连线展示多个亚组之间的关系，包括且不限于基因、基因片段、亚型。一般可应用的场景有：展示基因融合（fusion），同一个基因的多个片段用同一种颜色，用线把不同基因间融合的片段连接起来，常见于肿瘤基因组DNA测序数据；展示调控关系，同一组基因用相同的颜色展示，基因间的正、负调控关系用两种颜色的线展示，组间的调控关系一目了然。

数据要求：

多个分组及其关系类型，包括且不限于基因、基因片段、亚型。

下游分析：

1.   补充展示部分的已有相关研究

2.   解释展示部分对研究课题的意义

图形示例：

1.调控关系circos图

图注：每个正方形的颜色代表其功能分组。红线表示正相互作用，蓝线表示负相互作用。

应用示例：

文献一：Abnormal intrinsic brainfunctional network dynamics in Parkinson’s disease

帕金森症中的异常脑功能网络动力学（于2017年12月发表在Brain. 上，影响因子11.814）

该文献利用circos图展示了脑内7种功能网络相互作用关系的两种状态。

文献二：Charting the transcriptionallandscape of cells of renin lineage following podocyte depletion（于2017年11月发表在PLoS One. 上，影响因子2.776）

足细胞衰竭后肾素谱系细胞的转录情况图示

该文献利用circos图展示了转录因子与典型通路/标志基因集之间的相互作用。