——genomeView代码 |
genomeView是对基因组的可视化,可以直观展示RNA-seq和ChIP-seq的信号,证实转录因子结合对基因转录的影响等等。
数据要求
RNA-seq和ChIP-seq等数据。
图形示例:
图注:
图片上方展示染色体位置,下方展示测序信号强度。
应用示例:
文献1:Genomic landscape and evolution of metastatic chromophobe renal cell carcinoma.(于2017年6月发表在JCI Insight.,影响因子6.041)
转移性肾嫌色细胞癌的基因组景观和演化
本文对转移性肾嫌色细胞癌进行了系统的基因组研究,文中绘制基因流览图对整个基因组数据进行了可视化。