原核链特异性转录组测序

产品介绍

原核链特异性转录组是研究有参考基因组物种转录组的一种有效手段。相对于传统转录组测序而言，链特异性转录组可以确定两条链的转录方向，为基因的进一步注释和功能分析提供更准确的信息，同时还可以挖掘转录组中的non-coding RNA信息。原核生物链特异性转录组项目中，可以挖掘新的ncRNA与反义（antisense）转录本；还可以进行基因结构的研究，例如操纵子鉴定，为基因网络调控的研究提供有力支持。同时探究细菌在不同时空条件下的基因表达变化，揭示基因组结构信息，深入挖掘sRNA调控信息。

技术流程

技术优势

流程优化，项目周期显著降低；

结合公共数据库样品信息联合分析，节省成本；

提供组学数据构建服务，让数据后期利用更加便利。

送样要求

RNA总量：RNA总量≥2ug；

RNA纯度：OD260/280在1.8-2.0之间，核酸完整无降解。

分析示例

样品基因表达水平聚类

差异基因可视化散点图及火山图

上下调差异基因GO注释柱形图

差异基因KEGG富集图

表达差异基因聚类图

sRNA预测

Snp信息统计

差异基因比较venn图

WGCNA共表达网络分析

差异基因KEGG注释的泰森多边形展示

基因集富集分析（GSEA）分析