真核无参转录组测序

产品介绍

真核生物转录组（无参）测序，是获得真核生物特定组织或细胞在某一状态下转录出来的RNA的原始测序数据，质控后进行组装获得unigene，并以此为参考序列进行后续的功能注释、SNP、SSR标记开发等分析，以及多个样本的差异基因表达分析和差异基因功能富集分析等，发现新的功能基因，为进一步研究提供技术支撑。

针对真核生物，我们采用Illumina Truseq^TM RNA sample prep Kit方法构建文库，其流程如下图所示：

针对无参考基因组的转录组研究，获得RNA-seq高质量测序数据后，需要将所有测序读段通过从头组装生成重叠群（contig）和单一序列（singleton）, 此项分析是后续处理及生物学功能分析的基础。 Trinity（http://trinityrnaseq.sourceforge.net/ , 版本号：trinityrnaseq-r2013-02-25） 是目前适用于Illumina 短片段序列组装的一款比较权威的软件，使用该软件对所有clean data进行从头组装。

技术流程

技术优势

1.可检测未知基因，发现新的转录本；

2.丰富的项目经验，组装和注释全方位分析基因表达水平和结构信息；

3.无需了解物种的基因或基因组信息，便可直接对任意物种进行全面的转录组分析。

送样要求

RNA总量：≥2ug

RNA浓度：≥100 ng/ul

RIN值：≥7.0

分析示例