生存预后建模分析案例分析

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参考文献:Van Neste L, et al. Detectionof High-grade Prostate Cancer Using a Urinary Molecular Biomarker–Based Risk Score. Eur Urol (2016),http://dx.doi.org/10.1016/j.eururo.2016.04.012改文章于2016年4月发表在 (影响因子17.298)

前列腺癌(PCa)是全球男性第二大最常被诊断的癌症,2012年估计有110万新病例和307500人死亡。目前前列腺癌的主要挑战在于提高早期对重要临床或high-grade PCa的检测。如果前列腺癌特定标记物能够有效检测惰性肿瘤和侵袭性肿瘤,就可以减少过度诊断和过度治疗的情况。理想情况下,生物标记物可在非侵袭样本中检测(例如尿液)。本研究的目的是验证基于genePanel的全尿mRNA检测,并建立分子谱与传统临床危险因素相结合的模型,该模型可用于前列腺活检高级别PCa (GS 7)准确识别患者。

文章思路:

1、获取数据:两组样本(cohort A:测试集,构建模型;cohort B:验证集)

两组数据的临床统计情况(table 1

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2、mRNA分子标志物的确定;

HOXC6 DLX1有最佳AUC0.76table 2),最终选定为mRNA分子标志物(GenePanel

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3、结合风险因子预测high-grade PCa

Model 1:回归模型的构建参数包括age, PSA, PSA density (PSAD), family history of PCa, DRE,history of prostate biopsy, HOXC6 and DLX1 expression levels

Model 2:不包括DRE参数

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4、验证风险指数模型

为验证HOXC6 and DLX1 expression对模型的影响,模型2使用临床构建风险指数模型,AUC指数为0.87,由于HOXC6DLX1表达的加入,致使模型的AUC提高到0.9

5、临床使用性与有效性

风险评分在分组PCaGS<=6PCa、GS>= 7PCa前列腺癌中均有显著意义的增加Fig.3

cohort B使用DCA评估risk score的临床效用,并与临床实践中使用的其他决策工具进行比较。(Fig.4

     

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Conclusion

基于HOXC6 and DLX1 的风险指数与传统临床风险因子(PSAD, DRE,PSA, age, history of prostate biopsy, and family history)可以预测high-grade前列腺癌,因此可用于决策,减少不必要的前列腺活检和潜在的过度治疗。该新开发的风险评分显著优于PCPTRC(一种多模式风险评估方法),并改善了PCa患者的诊断和管理。未来的研究可能表明,额外的参数可以进一步优化高级别PCa的诊断,而不会导致高不必要的活检率。


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