肺腺癌患者预后相关PD-L1和肿瘤突变负荷关联的2-mRNA特征

A Combined Two-mRNA Signature Associated With PD-L1 and Tumor Mutational Burden for Prognosis of Lung Adenocarcinoma

肺腺癌患者预后相关PD-L1和肿瘤突变负荷关联的2-mRNA特征

一、摘要：
作为高发病率和高死亡率的恶性肿瘤，肺癌对人类生命和健康构成严重威胁。肺腺癌（LUAD）是肺癌最常见的组织学亚型，并具有其独特的生物学特性。近年来，免疫治疗的迅速兴起已完全改变了LUAD的治疗方式。无法从常规手术，化学疗法或放射治疗中受益的患者显然将从这种新兴治疗中受益。大量研究证明肿瘤突变负担（TMB），微卫星不稳定性（MSI），肿瘤淋巴细胞（TIL） ，以及其他可以用作预测免疫疗法反应的生物标志物。因此，免疫疗法相关的生物标志物对于筛查受益的非小细胞肺癌（NSCLC）患者尤其重要。鉴于此，作者试图从多个基因表达数据集中找到与PD-L1和TMB密切相关的基因，以探索可以准确预测LUAD的预后和免疫治疗反应的生物标志物。

二、材料方法：
TCGA-LUAD，GEO，HPA；差异表达，PD-L1，单变量cox，多变量cox，TMB

三、结果：
1.候选基因获取

图1.TCGA与GEO数据识别候选基因

2.预后特征的构建和评估

图2.风险评分生存分析与验证

3.预后特征在不同临床亚组中的适用性

图3.不同临床特征中的预后效能

4.10个交集基因的突变分布与TF

图4.突变与转录因子网络

5.特征基因在mRNA和蛋白质水平上的表达和生存

图5.mRNA和蛋白水平以及生存

6.特征基因和风险评分与免疫检查点和TMB的关系

图6.免疫检查点和TMB相关性

7.肿瘤免疫景观和通路富集


图7.免疫浸润与通 路富集

8.列线图的构建与预测性能

图8.独立因子与列线图

总结：

文章以PD-L1为切入点，识别和验证了肺腺癌中预后特征，针对性更强。虽说文章短小精悍，但是内容和图却是非常丰富的。

转自生信人

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