差异基因比较案例分析

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这篇文章于2019年5月发表在（影响因子11.878）

恶性胶质瘤 (GBM)是常见的恶性原发性脑瘤，手术切除后其治疗耐药性以及复发性导致恶性胶质瘤的5年生存率仅为5.5%。烷基化药物TMZ是治疗GBM的常规药物，然而GBM对TMZ的抗药性又致其难以进行。因此这篇文章进行了GBM对TMZ耐药机制的研究，并发现了全新的抗GBM耐药性靶点lncRNA:Lnc-TALC。

GBM耐药机制：lnc-TALC可以通过竞争性结合miR-20b-3p调节c-Met信号通路，通过调节乙酰化的表达和TMZ抗性组蛋白H3激活Stat3 / p300复合物以促进MGMT。

研究思路：

1、lnc-TALC在TMZ-resistant恶性胶质瘤细胞中高表达

实验和数据库数据差异分析找出并确定lnc-TALC在TMZ-resistant恶性胶质瘤细胞中高表达。

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2、磷酸化的AKT / FOXO3调节lnc-TALC表达

AKT影响FOXO家族，使用数据库(JASPAR)预测lnc-TALC的DNA结合元件（MBEs），发现FOXO3，验证发现它参与调节lnc-TALC的表达。

3、lnc-TALC促进TMZ耐药细胞中的c-Met表达

数据库差异分析,找出显著高表达基因以及基因通路；

c-Met signaling pathway影响 lnc-TALC诱导的TMZ抗性。

4、miR-20b-3p参与调节Lnc-TALC介导TMZ耐药性

ceRNA网络：数据库查找可靶向结合Lnc-TALC和MET 3′UTR的miRNA(miR-20b-3p and miR-335-3p)；

lnc-TALC可以通过竞争性结合miR-20b-3p调节c-Met信号通路

5、Lnc-TALC通过调节H3乙酰化增加MTMG

lnc-TALC通过重构组蛋白H3在MGMT启动子区乙酰化，增加MGMT表达

MTMG是一种蛋白修复酶,参与烷基化药物治疗癌症的过程

Conclusion:

通过lncRNA芯片发现AKT介导的TMZ耐药诱导的GBM中lncRNA lnc-TALC通过重构组蛋白H3在MGMT启动子区乙酰化，从而捕获miR-20b-3p，激活c-Met，增加MGMT表达。lnc-TALC可作为克服TMZ耐药的治疗靶点，提高GBM患者TMZ化疗的临床疗效.

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