真核有参转录组测序

产品介绍

转录组测序也称为RNA-Seq,能够全面快速地获得某一物种特定组织或细胞在某一状态下转录出来的转录本序列,并与参考基因组比对,获得基因覆盖度和测序饱和度等,分析基因表达水平、差异表达基因、可变剪切、基因融合、基因结构优化、SNPSSR和预测新转录本等。针对人、小鼠等模式生物,还可进行蛋白互作网络分析,深入研究基因功能,指导网络调控机制的进一步研究。

针对真核生物,我们采用Illumina TruseqTM RNA sample prep Kit方法构建文库,其流程如下图所示:

有参转录组文库构建.png


技术流程

(改)真核有参转录组测序.jpg


技术优势

1.无需预先针对已知序列设计探针,即可对任意物种的整体转录活动进行检测;

2.可提供更精确的数字化信号,更高的检测通量以及更广泛的检测范围;

3.可对低起始量或完整度低的样品进行文库构建;

4.个性化的生物信息解读和分析。


送样要求

RNA总量:≥2ug

RNA浓度:≥100 ng/ul

RIN值:≥7.0


分析示例

01

差异基因可视化散点图及火山图

有参转录组案例1.png



02

上下调差异基因GO注释柱形图

有参转录组案例2.png



03

SSR的分布情况

有参转录组案例3.png



04

差异基因共表达网络图

有参转录组案例4.png

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