研究背景
白塞氏病(Behcet disease, BD)又称白塞综合症或贝赫切特综合征,是一种全身性免疫系统疾病。白塞氏病有较强的地域分布特征,多见于希腊等地中海沿岸国家、土耳其等中东国家以及中国、朝鲜、日本等东亚国家,与古代丝绸之路大致吻合,因此又被称为“丝绸之路病”。作为一种慢性、多系统自体炎症性疾病,白塞氏病特征多见复发性口腔和生殖器溃疡、葡萄膜炎、皮肤病变,及血管、神经和胃肠道表现等,被认为是葡萄膜炎最常见的原因之一,也是失明的主要原因。
图片来源 https://www.osmosis.org/learn/
文章速递
研究团队采用Olink Target 96 Immune Response panel对上述血清样本的92个免疫反应相关蛋白进行了检测,找到43种差异表达蛋白(Differentially Expressed Proteins, DEPs)。该文章不仅揭示了BD独特的免疫反应相关蛋白谱,还表明了IL10、FCRL3、MASP1、 NF2、FAM3B和MGMT可作为白塞病潜在免疫生物标志物。此外,研究者们还建立了一种全新的分子疾病分类模型,用于识别白塞病亚群。
队列设计
研究结果
呈现白塞病和健康对照之间的前25种免疫相关差异表达蛋白的箱线图
在此基础上,研究人员对白塞病的差异表达蛋白DEPs进行了一系列生物信息学分析,包括主成分分析和聚类分析。随后,研究人员又进行了系统的GO富集和KEGG通路分析,深入研究了DEPs的生物学功能。
GO富集显示:下调的DEPs主要富集于toll like receptor 9、正调控的I-κB激酶/NF-κB、toll-like receptor、NIK/NF-κB,及I-κB激酶/NF-κB信号传导通路;上调的DEPs主要富集在调节适应性免疫反应、调节淋巴细胞介导的免疫、基于免疫球蛋白构建的免疫受体体细胞重组调节主动免疫应答、调节白细胞介导的免疫力和基于免疫球蛋白信号通路的适应性免疫应答。
KEGG信号通路分析显示:下调的DEPs主要富集于NF-κB、弓形虫病、致心律失常、右心室心肌病、ECM受体相互作用和肥厚型心肌病信号通路;上调的DEPs主要富集于C型凝集素受体、疟疾、IgA产生的肠道免疫网络、移植物抗宿主病,及KEGG中非洲锥虫病信号通路。
此外,研究者基于43个DEPs、临床表型、性别和年龄构建了BD患者共识集群,累积分布函数(CDF)曲线以及CDF曲线下面积的相对变化(K=2-7)表明当K=2时,共识聚类最稳定。与组2相比,组1中有21个蛋白上调和1个蛋白下调。
BD患者的共识集群