Mouse Exploratory应用场景

我们从①经典案例分享②panel蛋白详细列表③panel选择的应用场景三个方面带大家了解Mouse Exploratory Target 96 panel,以便后续进行实验设计



一、 Mouse Exploratory经典案例分享:



Olink蛋白质组助力发现调节性T细胞在肝炎中有害的作用

研究内容:


非酒精性脂肪性肝炎(NASH)由脂肪变性和代谢性炎症引起。虽然先天免疫反应的参与已被证实,但适应性免疫反应在NASH中的作用仍有争议。同样,调节性T细胞(Treg)在NASH中的作用尚不清楚,尽管最初的临床试验旨在针对这些调节性反应。作者采用高脂高碳水化合物(HF-HC)饲料喂养耐NASH的BALB/c小鼠以及相应的重组激活Treg缺陷株诱导NASH并研究适应性免疫反应的作用。HF-HC饲粮诱导BALB/c小鼠肝内T细胞强烈激活,提示具有抗原驱动作用。相比之下,缺乏适应性免疫反应的影响是显著的。BALB/c Rag1−/−小鼠的NASH明显恶化,并伴有m1样巨噬细胞数量的急剧增加。作者发现在NASH中肝内Treg数量增加,但过过性Treg转移或抗分化聚类(cd3)治疗都意外增加了脂肪变性和丙氨酸氨基转移酶水平,而不影响NASH。

结论:尽管在NASH中肝内T细胞被激活并少量克隆扩增,但这些影响被Treg数量的增加所抵消,小鼠NASH适应性免疫的消融导致NASH明显加重,说明Treg不是代谢性炎症的调节因子,而是增强代谢性炎症。



② Olink实验技术:


Mouse Exploratory




二、 Mouse Exploratory 92种蛋白详细信息


第一列:92种蛋白的Uniprot ID 第二列:92种蛋白的名称 第三列:蛋白的功能描述




三、 Mouse Exploratory 应用场景
① 生物学过程


92种蛋白在生物学过程方面和发育过程、信号转导、细胞代谢过程、细胞分化、基因表达调控、胁迫应答、细胞增殖、细胞凋亡、免疫应答等相关。



② 细胞亚定位


92种蛋白在主要分为三大类:细胞内蛋白、细胞分泌蛋白和细胞膜表面蛋白。



③ 通路富集分析


对其中富集最显著的(p<0.05)的通路进行分析,92种蛋白富集通路数目最多的为Cytokine-cytokine receptor interaction(细胞细胞因子受体通路包含24个蛋白)、其次Pathways in cancer(包含16个节点蛋白)、以及MAPK signaling pathway(包含14个节点蛋白)、IL-17 signaling pathway(包含11个节点蛋白)、TNF signaling pathway(包含11个节点蛋白)等、PI3K-Akt signaling pathway(包含9个节点蛋白)、AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications(包含9个节点蛋白)。如果老师关注小鼠或大鼠的这些通路节点蛋白的变化,可以选择Olink Target 96的Mouse Exploratory试剂盒进行蛋白层面的检测。





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本文感谢联川生物提供资料和视频。

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