单细胞+AI 4小时锁定致命真菌感染!上交大团队突破性技术改写抗真菌检测格局

每年,全球有超过150万人因真菌感染丧生,其中侵袭性真菌感染对免疫功能低下者和危重患者更是致命威胁。念珠菌作为最常见的致病真菌,其治疗的关键在于及时精准的抗真菌药敏检测(AFST——但传统检测方法需耗时24-48小时,往往延误最佳治疗时机。

如今,上海交通大学李敏、沈峰团队带来突破性解决方案!他们研发的单细胞抗真菌药敏检测平台(sc-AFST),将检测时间从数十小时压缩至4小时,且准确率与金标准高度一致,相关成果已发表于国际权威期刊《Analytical Chemistry》, 并将作为期刊封面进行发表!!!

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核心突破:微流控+AI,打造检测加速引擎

传统AFST依赖微生物培养,等待时间长且难以捕捉单细胞水平的药物反应差异。新平台创新性地将SlipChip微流控技术与深度学习算法相结合,实现三大核心突破:

1. 单细胞精准分区SlipChip芯片包含6组阵列、共13440个微孔,每个微孔仅250 pl容积,能将真菌细胞随机封装进独立液滴,避免交叉污染,同时实现单细胞水平的药物暴露实验。

2. AI智能分析闭环:通过ResNet-34分类模型识别含菌液滴,灵敏度高达98.8%U-Net分割模型精准提取细胞形态特征,分割准确率超93%。无需荧光标记,仅通过明场成像即可量化细胞生长动态。

3. 快速MIC判定:基于Richards生长模型分析细胞最大生长速率(MGR),通过种群水平的生长速率分布,4小时内即可确定最低抑菌浓度(MIC),比传统方法快6-12倍。

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临床验证:100%分类一致,精准指导治疗

在临床验证中,该平台对白色念珠菌标准菌株及10株临床分离株(源自血液、尿液、宫颈分泌物等样本)进行检测,结果令人振奋:

  • 与金标准微量肉汤稀释法(BMD)相比,10株临床菌株的药敏分类完全一致,仅1株出现微小MIC稀释差异;

  • 对氟康唑、两性霉素B等常用抗真菌药物的MIC检测结果,均落在CLSI(临床和实验室标准协会)参考范围内;

  • 成功捕捉到不同药物的作用差异:氟康唑在MIC以上浓度仍有部分细胞残留生长,而两性霉素B则实现完全抑制,为药物选择提供精准参考。


技术优势:不止于快,更在于精准与普适

  1. label-free无标记设计:无需荧光染色或特殊处理,适用于多种真菌物种,降低临床应用门槛;

  2. 单细胞分辨率:揭示种群内的药物反应异质性,为耐药机制研究提供新视角;

  3. 高兼容性:与现有临床检测流程兼容,未来可拓展至非白色念珠菌、隐球菌、曲霉菌等多种致病真菌。


临床价值:为重症患者赢得救命时间

侵袭性真菌感染的死亡率高达30%-50%,治疗延迟每增加1小时,患者预后风险显著上升。sc-AFST平台的快速检测能力,能帮助临床医生在4小时内启动靶向治疗,避免盲目使用广谱抗真菌药物,既提升治愈率,又减少耐药性产生。目前,该平台已完成技术验证,未来将进一步开发塑料芯片并集成自动化样本处理模块,推动临床转化应用。

这项由上海交通大学医学院附属仁济医院、上海交通大学医学院生物医学工程学院、郑州上海交大产业技术研究院联合攻关的成果,不仅打破了传统抗真菌检测的速度瓶颈,更通过单细胞分析与AI赋能,为感染性疾病诊疗开辟了精准化、快速化的新路径。未来,随着技术的进一步成熟,有望成为临床微生物实验室的常规检测工具,为全球抗真菌治疗带来革命性改变!

论文链接:https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.analchem.5c07370

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