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Inmmune gene

免疫学研究是目前科研领域争相研究的热点，肿瘤免疫细胞浸润是其中一种。肿瘤免疫细胞浸润是指免疫细胞从血液中移向肿瘤组织发挥作用。我们从肿瘤组织中分离出浸润免疫细胞含量，计算基因与浸润免疫细胞含量的相关性，筛选出影响免疫浸润的候选基因。

基本原理：

从基因矩阵数据中提取免疫细胞含量，生成免疫细胞含量矩阵；

计算目标基因与浸润免疫细胞含量的相关性，筛选与浸润免疫细胞含量高度相关的基因。

术语解读：

相关性系数（pearson,spearman, kendall）反应两个变量之间变化趋势的方向以及程度。相关系数范围为-1到+1。0表示两个变量不相关，正值表示正相关，负值表示负相关，值越大表示相关性越强。

数据要求：

肿瘤数据表达矩阵

图形示例：

应用示例1：于2019年8月发表在Oncol Rep.，影响因子3.041

文章主要研究肿瘤免疫微环境对膀胱癌的影响机制，作者应用生物信息学方法分析免疫浸润情况，发现M2巨噬细胞浸润水平与膀胱癌的组织学分级、病理分期、生存期等有关。推断膀胱癌特异性基因组改变，如基因突变和拷贝数改变，可能是M2巨噬细胞浸润的重要驱动因素。

膀胱癌组织学分级相关免疫浸润分析

与病理级相关联的膀胱癌免疫浸润

ssGSEA评分代表单个样本免疫细胞浸润水平

CIBERSORT值代表每个样品的免疫细胞浸润分数