Normalize the OTU Table(标准化OTU Table)
分析模块将OTU Table中样品的OTU序列数进行均一化,使得每个样品的OTU序列数求和一致。均一化的数值设为1,则为相对丰度值。在处理过程中,每个样本只是简单的根据相对丰度进行等比例的放大和缩小。建议使用高级分析中的抽平模块("Creates a subsampled OTU table by random sampling of the absolute abundance OTU table"),进行随机抽样,生成样本序列数一致的OTU Table。
输入:
OTU Table文件:
OTU ID Bio1 Bio2 Bio3 Bio4 Bio5 Bio6 Bio7 Bio8 Bio9 Bio10
OTU1 0 0 0 0 0 6 34 104 367 254
OTU2 52 335 18 49 0 0 0 0 0 0
OTU3 0 0 0 0 5 0 0 0 0 0
设置参数:
所有样本均一化为1000
输出:
每个样本单独均一化后的OTU Table文件:
OTU ID Bio1 Bio2 Bio3 Bio4 Bio5 Bio6 Bio7 Bio8 Bio9 Bio10
OTU1 0 0 0 0 0 0.200113397591969 1.39498625528248 2.89524233735141 9.07091129291381 8.1658897283395
OTU2 1.30791287288093 10.4625378681408 0.581564408258215 1.29609056763477 0 0 0 0 0 0
OTU3 0 0 0 0 0.166777851901268 0 0 0 0 0
OTU4 0.301826047587907 0.437240388519317 0 0.423213246574618 0 0 0 0 0 0