精选文献推荐

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KrakenUniq: confident and fast metagenomics classification using unique k-mer counts


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链接:

https://doi.org/10.1186/s13059-018-1568-0



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发布杂志:Genome Biology

发布时间:16 November 2018


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宏基因组分类器 Kraken 的进化版 —— KrakenUniq


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02

The Genomics of Oryza Species Provides Insights into Rice Domestication and Heterosis



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链接:

https://www.annualreviews.org/doi/full/10.1146/annurev-arplant-050718-100320



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发布杂志: Annual Review of Plant Biology

发布时间:April 2019


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结合研究热点讲解水稻的进化历史


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野生和驯化水稻种系的系统发育树和水稻驯化的单源模型


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03

FastqPuri: high-performance preprocessing of RNA-seq data



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链接:

https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12859-019-2799-0


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发布杂志: BMC Bioinformatics

发布时间:3 May 2019


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RNA-seq 的预处理一条龙工具


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FastqPuri的工作流程。

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Ultrafast search of all deposited bacterial and viral genomic data



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链接:

https://www.nature.com/articles/s41587-018-0010-1/


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发布杂志: Nature Biotechnology

发布时间:04 February 2019


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超高速细菌、病毒基因组的序列搜索方法


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Fig. Sequence matching methods.

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