蛋白组生物信息学理论与实践

本次研习班主要讲解蛋白组学数据处理功能分析以及统计分析,并且通过实际上机操作学习如何以文章为导向对蛋白质组实验数据进行分析与作图,结合实际案例,进行实战演练。特邀讲师均为在蛋白质组实验及生物信息分析方面拥有丰富科研项目经验的专家。希望通过理论讲解和实际操作演练,帮助学员解决当前难题,拓展研究思路,提升科研水平快速发表更高水平的研究论文。

主办单位:上海鹿明生物科技有限公司主办,云生物协办。

开班时间:2017年1025日(周)至1027日(周五)

开班地点:上海市闵行区长昌林路126号维也纳国际酒店会议厅

收费标准1500元/人

其他事项:

1. 发票与会务通知于研习班结束前发放

2. 1024日报名截止,汇款学员视收到汇款凭证(截图、扫描件)为成功报名

3. 学员需自备笔记本电脑,具体课程安排以开班当天课程表为准

4. 交通、食宿费用自理(除中餐外)

付款方式:

汇款至: 上海鹿明生物科技有限公司

账户号: 0382 7530 0400 2159 3

开户行: 中国农业银行股份有限公司上海慧创支行

1. 转账或汇款时仔细核对账户名称及账号,汇款用途注明:10月蛋白组生信分析研习班,云生物报名

2. 研习班报到当天现金支付

联系方式

 联系人:王老师

 座机:021-59189673      手机:13472892889

   Q Q:1651593433                邮箱:market@lumingbio.com

讲课师资:

戴文韬:博士,上海药物转化工程技术研究中心生物信息主管,上海生物信息技术研究中心助理研究员,在多组学数据整合分析方面参与发展了差异化调控网络分析方法PDX技术领域,作为国内规模最大的公益性PDX模型库数据平台负责人。设计并初步开发了平台配套的包括PDX生物样本资源、临床信息和组学遗传信息存储分析等数据链条高度整合的一体化MEDPDX信息化系统。

于复东:博士,毕业于中国科学院上海生命科学研究院,获生物信息学博士学位。毕业后一直从事二代测序等高通量数据分析、肿瘤基因组学、及相关数据库开发和分析平台建立等生物信息学研究工作。目前主要从事肿瘤基因组学和精准医疗方面的研究工作,运用系统生物学的方法研究可以应用于临床早期诊断、预后、复发和转移相关的分子标志物基因及其功能等。

舒烈波:博士,鹿明生物技术总监,协助科研人员在MCP、Proteomics、Metabolomics等几乎所有主要蛋白质组及代谢组领域杂志发表研究论文百余篇,在蛋白质组及代谢组实验设计、技术以及相应的数据整理分析和论文投稿方面有较丰富的经验。

万国庆:博士,鹿明生物高级科学家,研究方向为药物开发及药效代谢组学,在系统生物学实验设计、技术以及相应的数据整理分析和论文投稿方面都有较丰富的经验。

陈   敏:鹿明生物生信部负责人,“组学金豆”系统(OmicsBean)开发与应用专家,专注于转录组、蛋白组和代谢组数据处理及生物信息学分析,在数据分析及结果解释方面经验丰富。

课程安排;


时间授课项目授课老师授课内容
10月25日


8:30-9:00
报到-开班仪式舒烈波主办单位及培训班课程介绍
9:00-11:30
组学概要及下机数据搜库,预处理方法介绍万国庆
蛋白组学,代谢组学详细介绍
蛋白组,代谢组质谱下机数据检索方法介绍
蛋白组,代谢组原始数据质量控制分析方法介绍




1330-17:00
蛋白组学数据差异筛选分析及操作陈敏
不同实验设计方案的蛋白组学数据差异蛋白筛选方法
差异蛋白筛选实战演练
10月26日


9:00-11:30
常用生物学数据库及分析工具使用介绍戴文滔
NCBI数据库详细介绍及各种数据查询下载
Uniprot数据库介绍及数据批量下载
Blast介绍及示例操作
1330-17:00
基于权威数据库的功能分析及实战演练戴文滔
Gene ontology功能介绍
Gene ontology操作展示
基于DAVID数据库进行GO功能富集分析
KEGG生物通路数据库介绍
KEGG中常用工具使用介绍
STRING蛋白相互作用数据库介绍和基本操作演示
10月27日


9:00-11:30
可视化工具Cytoscape在构建相互作用网络中的应用于复东
Cytoscape软件介绍
Cytoscape软件上传数据格式
Cytoscape软件参数设置
Cytoscape软件数据和图片导出
运用Cytoscape软件构建蛋白相互作用网络实例操作


13:30-1530
维恩,层次聚类和热图等表达模式统计分析方法于复东
维恩分析作图
层次聚类分析作图
热图分析作图
15:10-16:30
多组学数据分析案例介绍于复东
从已发表文章中剖析解读多组学分析内容和分析技巧


16:30-17:00
实践与答疑,交流部分老师
实践与答疑



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