转录组软件分析简介

转录组标准版模块


1、原始数据处理模块:

原始数据质控
原始数据质控原始数据统计



SE数据质量剪切PE数据质量剪切
   

原始数据比对转录组评估



表达量计算(Transcripts-Based Analysis)


2、数值分析相关模块:

差异表达分析热图


PCA分析子表达模式分析(时序育)
     
PCOA分析样品hclust聚类树状图
     
相关性系数分析差异基因维恩图


F‍PKM箱线图样本距离分析


FPKM分布图差异基因调控网络图
‍     

差异基因子表达模式网络图


3、GO、KEGG分析模块:

差异基因GO注释GO有向无环图


差异基因组KEGG注释GO富集散点图
     
GO富集分析GO富集柱状图
     
KEGG富集分析   KEGG富集散点图



转录组高级版模块,新增:


新转录本预测可变剪切分析
     
Indel分析SNP分析
   

表达量计算(Reference and Annotation Based Analysis)




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