转录组标准版模块
1、原始数据处理模块:
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原始数据质控 | 原始数据统计 |
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SE数据质量剪切 | PE数据质量剪切 |
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原始数据比对 | 转录组评估 |
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表达量计算(Transcripts-Based Analysis) |
2、数值分析相关模块:
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差异表达分析 | 热图 |
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PCA分析 | 子表达模式分析(时序育) |
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PCOA分析 | 样品hclust聚类树状图 |
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相关性系数分析 | 差异基因维恩图 |
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FPKM箱线图 | 样本距离分析 |
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FPKM分布图 | 差异基因调控网络图 |
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差异基因子表达模式网络图 |
3、GO、KEGG分析模块:
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差异基因GO注释 | GO有向无环图 |
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差异基因组KEGG注释 | GO富集散点图 |
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GO富集分析 | GO富集柱状图 |
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KEGG富集分析 | KEGG富集散点图 |
转录组高级版模块,新增:
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新转录本预测 | 可变剪切分析 |
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Indel分析 | SNP分析 |
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表达量计算(Reference and Annotation Based Analysis) |