Agilent aCGH芯片介绍:
基于Agilent基因芯片的比较基因组杂交技术, aCGH(array-based Comparative GenomicHybridization)使得研究者能够快速地在全基因组或目标区域上对染色体水平的缺失、扩增等结构变化进行精确定位。Agilent aCGH 的探针覆盖全基因组,在包括基因区域(内含子区、外显子区)、基因间区域以及对疾病研究极其重要的亚端粒区域(重复序列除外)的分布大致相同。具有高灵敏度、高精确度、高分辨率的优点,也是目前在全基因组范围进行CNV研究最准确、经济的技术方法。同时,还可以针对目标区域定制目标区域aCGH芯片。无论全基因组覆盖,还是目标区域定制aCGH芯片,高密度的探针设计能够帮助我们寻找到CNV区段的断裂点,这也为后续生物学功能研究提供坚实的数据基础。
芯片特点 :
实验周期短;
根据aCGH实验技术要求专一设计的优化探针, 探针同时涵盖基因组表达区与非表达区;
对已知疾病基因相关区域实行更高密度覆盖, 检测灵敏度高;
高密度的探针设计能够帮助我们寻找到CNV区段的断裂点,而基于二代测序相关技术无法精确实现;
样品需求量低,仅需500ng基因组DNA即可进行实验;同时还可检测福尔马林固定的石蜡样品;
数据处理方法成熟、快速,相关软件简便易用;
Agilent覆盖全基因组的800万已验证的aCGH探针库,客户可以自由访问
可以根据自己要求,进行定制,还有针对特定区域的“zoom-in”探针设计,提供更高的分辨率。
芯片名称 | 芯片规格 | 探针间距 | 数据库 |
Human Genome CGH Microarrays | 4x180K | 13 KB overall median probe spacing (11 KB in Refseq genes) | UCSC hg18 (NCBI Build 36), March 200 |