统计差异表达分析结果

　　分析模块，输入差异表达分析HTML结果文件，可由分析模块“Differential Expression Analysis”和“Parse Cuffdiff results”生成。根据设置的pval、FDR/padj、logfc阈值，生成差异结果数目统计表。

　　输入：

　　差异表达分析HTML结果文件，可由分析模块“Differential Expression Analysis”和“Parse Cuffdiff results”生成。

　　示例：

　　设置差异结果，pval阈值为：1，FDR阈值为：0.05，logFC阈值为：1。

　　输出：

　　差异结果数目统计表。

　　示例：

Comparison      DE_number      Up_Number      Down_Number

T4_vs_T5          0       0       0

T4_vs_T6          0       0       0

T4_vs_T7          29     28     1

T4_vs_T8          873   507   366

T4_vs_T9          5       0       5

T5_vs_T6          0       0       0

T5_vs_T7          20     20     0

T5_vs_T8          821   474   347

T5_vs_T9          7       0       7

T6_vs_T7          29     29     0

T6_vs_T8          888   507   381

T6_vs_T9          1       0       1

T7_vs_T8          373   180   193

T7_vs_T9          9       0       9

T8_vs_T9          991   448   543

　　其中，

　　第一列为，具体的比较样本信息。

　　第二列为，差异结果数目统计。

　　第三列为，上调差异结果数目统计。

　　第四列为，下调差异结果数目统计。

　　关于HTML链接的文件内容和格式。

      *.DE_results文件参考分析模块“Differential Expression Analysis”、“Parse Cuffdiff results”的帮助文档。