生成分组文件

Generate sample group file from file header(生成分组文件)


  分析模块,根据输入制表符分隔文本文件的表头信息,生成对应的样品分组信息文件。


  输入:

  制表符分隔的文本文件(如Count矩阵、FPKM矩阵等)。

  示例:

        T4    T5    T6    T7    T8    T9

BM590_A0001         565   505   843   286   247   1909

BM590_A0002         362   295   512   124   118   876

BM590_A0003         235   213   333   126   47     1021

BM590_A0004         291   325   447   404   878   1600

BM590_A0005         530   607   848   709   1194         2001

BM590_A0006         456   425   786   287   139   1857

……

  设置参数:

分组:Group Namegroup1Column Range2-3,4

分组:Group Namegroup2Column Range5-6


  输出:

  样品分组信息文件。

  示例:

T4     group1

T5     group1

T6     group1

T7     group2

T8     group2


!!建议使用以下方式生成样本分组信息文件:

       1、在文件浏览器中,选中对应的矩阵文件。

5.jpg



      2、点击右键菜单New -> Sample Group File,弹出设置样本分组信息窗口。

6.jpg



  或者在项目编辑窗口中,选中矩阵输入文件,点击右键菜单 Get group design file from tabular file.,弹出设置样本分组信息窗口。

      !!注:文件格式必须是tabular,可通过Reset Format进行文件格式的更改。

7.jpg



      3、设置分组信息,点击OK按钮得到对应的样本分组信息文件。

8.jpg

9.jpg



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