Filter OTU/Taxon Table(丰度表过滤)
分析模块对低丰度的OTU进行过滤。
输入:
OTU Table文件:
OTU ID Bio1 Bio2 Bio3 Bio4 Bio5 Bio6 Bio7 Bio8 Bio9 Bio10
OTU1 0 0 0 0 0 6 34 104 367 254
OTU2 52 335 18 49 0 0 0 0 0 0
OTU3 0 0 0 0 5 0 0 0 0 0
设置参数:
注:每个OTU对应的一行求和值不小于500,并且一行求和的百分比不低于1%。设置任意小于0的值则过滤条件无效。
输出:
过滤后的OTU Table文件:
OTU ID Bio1 Bio2 Bio3 Bio4 Bio5 Bio6 Bio7 Bio8 Bio9 Bio10
OTU119 934 1237 856 404 90 267 271 61 424 367
OTU145 4834 93 12 16 5 1 0 1 9 17
OTU191 1 0 0 0 77 4647 6 29 27 12
OTU251 3209 3731 7070 4750 1993 482 96 749 4696 5951
OTU260 741 3344 271 569 0 1 1 0 0 0