Select top N highest abundance rows in OTU/Taxon Table(获取丰度最高的N个OTU)
分析模块对每个OTU在所有样品中的丰度信息进行求和,输出丰度信息求和最高的OTU信息。
输入:
OTU Table文件:
OTU ID Bio1 Bio2 Bio3 Bio4 Bio5 Bio6 Bio7 Bio8 Bio9 Bio10
OTU1 0 0 0 0 0 6 34 104 367 254
OTU2 52 335 18 49 0 0 0 0 0 0
OTU3 0 0 0 0 5 0 0 0 0 0
设置参数,选择输出所有样品中,丰度信息求和最高的前20(Top 20)。
输出:
丰度求和Top 20的OTU Table文件(由大到小排序):
OTU ID Bio1 Bio2 Bio3 Bio4 Bio5 Bio6 Bio7 Bio8 Bio9 Bio10
OTU251 3209 3731 7070 4750 1993 482 96 749 4696 5951
OTU956 1967 204 79 671 12 76 2609 18370 3899 524
OTU932 13 24 125 10 1934 106 118 966 9766 3589
OTU524 36 778 292 11319 12 12 159 81 1864 362
OTU1053 2715 502 199 387 8 90 8733 417 644 128