Get a sub-OTU Table(生成OTU子表)
分析模块根据样品分组信息表中第一列对应的样品信息,抽取输入的OTU Table中对应的样品丰度信息,生成一个只包含这些样品的子OTU Table。通常,对于第二个文件输入参数而言,只要第一列包含所需的样品名信息,就可以作为输入文件。
输入:
OTU Table文件:
OTU ID Bio1 Bio2 Bio3 Bio4 Bio5 Bio6 Bio7 Bio8 Bio9 Bio10
OTU1 0 0 0 0 0 6 34 104 367 254
OTU2 52 335 18 49 0 0 0 0 0 0
OTU3 0 0 0 0 5 0 0 0 0 0
样品分组信息表:
Bio1 group1
Bio2 group1
Bio3 group1
Bio4 group2
Bio5 group2
其他参数默认。
输出:
对应生成的子OTU Table文件:
OTU ID Bio1 Bio2 Bio3 Bio4 Bio5
OTU2 52 335 18 49 0
OTU3 0 0 0 0 5
OTU4 12 14 0 16 0
OTU5 2 0 0 0 0
OTU6 2 2 13 2 1
还可以使用以下方式生成OTU Table子表:
1、在文件浏览器中,选中对应的OTU Table文件。
2、点击右键菜单New -> subSet OTU Table,弹出子表样本信息设置窗口。
3、选择对应的样本,点击OK按钮得到对应的OTU Table子表信息文件。