Alnylam 制药｜Olink 蛋白组学助力全球首款RNAi药物Patisiran临床生物标志物研究

转自Olink

Alnylam制药公司


Alnylam制药公司作为RNAi疗法的领导者，已成功将获得诺贝尔奖的RNAi技术转化为了一类全新的创新药物。Alnylam已将四款RNAi药物推向市场，包括FDA批准的全球首款RNAi药物Onpattro (Patisiran)。据Alnylam2021年报显示，全年营收6.62亿美元，同比增长83%，核心产品Onpattro (Patisiran)去年营收4.75亿美元，占全年营收超过70%。Alnylam首席执行官John Maraganore博士提出公司愿景“到2025年Alnylam将成为世界上5大独立的全球性生物技术公司之一”。

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Alnylam创立于2002年，专注于RNAi治疗，开发了两种siRNA递送技术，包括脂质纳米粒子递送平台和N-乙酰半乳糖胺-siRNA递送平台。Alnylam建立了针对罕见疾病和常见疾病的强大临床管线、具备了覆盖全球的强大商业化能力并拥有支持公司持续发展的稳健资金流。Alnylam已经与英国Biobank展开合作，从该组织的数据库中发掘已经在科学文献中报道过的基因突变，现已发现约800个基因。如果这些携带功能丧失突变的等位基因与降低特定疾病风险相关，那么它们可能成为适于RNAi敲低的治疗靶点。


hATTR 淀粉样变性


遗传性转甲状腺素（hATTR）淀粉样变性是一种可遗传的退行性致命性罕见病，由TTR基因突变导致。TTR蛋白主要在肝脏中产生，正常情况下是维生素A的载体。TTR基因突变可导致异常的淀粉样蛋白积聚，并损害身体器官和组织，如周围神经和心脏，导致难以治疗的周围感觉运动神经病变、自主神经病变和/或心肌病以及其他疾病表现。hATTR淀粉样变性代表了一个关键的未满足医疗需求，具有很高的发病率和死亡率，全球约有5万名患者。确诊后的中位生存期为4.7年，伴有心肌病的患者具有更短的生存期（中位数为3.4年）。



Patisiran（商品名Onpattro ）是Alnylam公司开发的一种靶向转甲状腺素蛋白的RNAi疗法，这类药物通过沉默一部分参与致病的TTR mRNA起作用。Onpattro将siRNA包裹在脂质纳米颗粒中，在输注治疗中将药物直接递送至肝脏，通过与编码异常TTR的mRNA相结合，阻止TTR的产生。2018年8月，该药获得FDA批准，用于由遗传性转甲状腺素蛋白淀粉样变性引起的周围神经疾病（多发性神经病）成人患者，成为了首款获得FDA批准的RNAi疗法，并在2021年营收4.75亿美元，为Alnylam公司核心产品。

文章解读

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Alnylam研究团队在2021年Neurology杂志（IF=9.91）上发表的文章中，首次使用Olink PEA蛋白组平台，对patisiran临床3期（APOLLO）治疗组/安慰剂组/健康组的参与者，进行了超过1,000个血浆蛋白标志物检测，发现66个蛋白标志物，包括Nfl，在接受治疗后有显著变化。通过对6个月和18个月治疗组的进一步系统研究，最终发现Nfl可作为神经损伤和多神经病变（polyneuropathy ）的生物标志物，在更早期ATTRv淀粉样病变进行诊断，并监控其疾病进展。

蛋白组学分析在APOLLO临床3期参与者中进行，包括136位Patisiran治疗患者，53位安慰剂患者和57位健康人。血浆中的1,161个独特的蛋白标志物采用Olink PEA技术进行系统检测分析。通过分析测定基线、治疗9个月和治疗18个月时的患者样品，使用线性混合模型来确定patisiran治疗对血浆中每种蛋白水平时间分布的影响。


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通过蛋白组分析发现有66个蛋白标志物，在patisran治疗前后显示有显著变化，其中Nfl蛋白标志物变化最为明显。另外，也发现心脏健康相关的生物标志物NT-ProBNP（Brain-type natriuretic peptide）在药物治疗后表现出明显改变，这与之前APOLLO正交方法学中的结果一致，同时也进一步验证了Olink PEA技术的一致性。

蛋白标志物Nfl，在诊断为ATTRv淀粉样病变患者血浆内，比健康人群相比，有4倍的提高。患者在接受Patisiran治疗后9个月和18个月两个时间点，对比安慰剂组，Nfl表达量都有显著降低。安慰剂非治疗组，18个月后，Nfl表达量有明显提高。

通过方法学一致性研究发现，Olink PEA技术和高灵敏度蛋白检测方法Simoa技术，在对血浆中Nfl蛋白标志物检测中具有同等的灵敏度和高性能，两种方法学的一致性R值可达0.96。Olink PEA方法可在6µL样品中同时完成3千种生物标志物的高性能检测。

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研究结论

Alynlam研究团队首次采用Olink PEA技术对Pastisran治疗临床3期患者队列进行血浆蛋白组学研究。通过对上千种生物标志物的系统分析，最终发现一个新型的蛋白标志物Nlf可用于监控hATTR疾病进展和药物治疗响应。同时Olink PEA技术发现的心脏健康相关的生物标志物NT-ProBNP的与APOLLO临床正交实验中阳性标志物一致；且Olink PEA技术与业内蛋白标志物金标准检测方法Simoa，在Nfl血浆学检测中具有同等的灵敏度和高性能。这意味着，通过临床队列血浆蛋白组研究，可发现新型蛋白标志物，对目前存在诊疗挑战的疾病，包括罕见病hATTR蛋白病变，有助于开发用于疾病早筛、早诊及药物响应评估的诊疗新方案。


参考资料：

1. http://investors.alnylam.com/news-releases/news-release-details/alnylam-announces-2020-product-and-pipeline-goals-and-provides

2. https://investors.alnylam.com/press-release?id=26471

3. Neurofilament Light Chain as a Biomarker of Hereditary Transthyretin-Mediated Amyloidosis. Neurology 2021;96:e412-e422

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