各样品OTU个数和序列数统计

Summary OTU Table(各样品OTU个数和序列数统计)


分析模块统计OTU Table中,每个样本的OTU数目和序列数。


输入:

OTU Table文件:

OTU ID     Bio1 Bio2 Bio3 Bio4 Bio5 Bio6 Bio7 Bio8 Bio9 Bio10

OTU1        0       0       0       0       0       6       34     104   367   254

OTU2        52     335   18     49     0       0       0       0       0       0

OTU3        0       0       0       0       5       0       0       0       0       0


输出:

OTU Table统计结果文件:

#Samples OTUs_Num      Seqs_Num

#Total       1057                   332355

Bio1 313   39758

Bio2 310   32019

Bio3 217   30951

Bio4 312   37806

Bio5 536   29980

Bio6 473   29983

Bio7 389   24373

Bio8 257   35921

Bio9 325   40459

Bio10        347   31105

其中,第一列是样本对应的OTU个数,第二列是样本对应的序列条数。



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