Agilent aCGH芯片:专业的CGH研究工具,探针覆盖所有基因组,包括基因区域(内含子区、外显子区)、基因间区域以及对疾病研究极其重要的亚端粒区域(除重复序列外),因此,利用此平台进行CGH分析具有敏感度高、精确度高、分辨率高的特点,与SNP芯片相比,实验数据可信度更高。
产品特点
1. 根据aCGH实验技术要求专一设计的优化探针,而非用其他SNP芯片替代探针;
2. 探针同时涵盖基因组表达区与非表达区(84% intragenic,16% intergenic),更全面;
3. 对已知疾病基因相关区域实行更高密度覆盖;
4. 样品需求量低,仅需0.5ng基因组DNA即可进行实验;同时还可检测福尔马林固定的石蜡样品;
5. 完善的数据处理软件(CGH Analytics software 3.2),简便易用;
6. 可高解析度地检测DNA拷贝数变化,包括:纯合、杂合、缺失;单、多拷贝扩增;染色体不平衡易位;
7. Agilent覆盖全基因组的800万已验证的aCGH探针库,客户可以自由访问,可以根据自己要求,进行定制,还有针对特定区域的“zoom-in”探针设计,提供更高的分辨率。
产品规格
芯片名称 | 芯片规格 | 探针间距 | 数据库 |
Human Genome CGH Microarrays | 1x1M | 2.1 KB overall median probe spacing (1.8 KB in Refseq genes) | UCSC hg18 (NCBI Build 36), March 2006 |
2x400K | 5.3 KB overall median probe spacing (4.6 KB in Refseq genes) | UCSC hg18 (NCBI Build 36), March 2006 | |
4x180K | 13 KB overall median probe spacing (11 KB in Refseq genes) | UCSC hg18 (NCBI Build 36), March 2006 | |
8x60K | 41 KB overall median probe spacing (33 KB in Refseq genes) | UCSC hg18 (NCBI Build 36), March 2006 | |
4x44K | 43 KB overall median probe spacing (24 KB in Refseq genes) | UCSC hg18 (NCBI Build 36), March 2006 | |
其他物种aCGH芯片: | |||
Mouse Genome CGH Microarrays,1M,4*180K,1*244K,2*105K小鼠 | |||
Rat Genome CGH Microarrays,1M,4*180K,1*244K,2*105K大鼠 | |||
Chicken Genome CGH Microarray, 1x244K鸡 | |||
SurePrint G3 Bovine CGH Microarray, 4x180K牛 | |||
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Agilent 定制aCGH芯片 | |||
Custom High-Definition CGH |
应用领域
· 发现新的生物标记,可用于临床诊断、疾病的分子分型等
· 研究肿瘤发生过程中伴随的基因变化,如染色体的畸变等
· 通过研究基因拷贝数目的变化,寻找新的原癌基因或抑癌基因
· 揭示生物体抗药性的机制及代谢过程中可能发生的基因组变化
服务流程
1. 样品超声打断基因组:待测样品(Test)和对照样品(reference)基因组DNA样本超声剪切成低分子量片段
2. 荧光标记:对Test (Cy5)和reference(Cy3) DNA样品进行标记
3. 芯片杂交:标记后的Test 和reference DNA样品混合、变性后与CGH芯片进行共杂交
4. 图像采集和数据分析:使用芯片扫描仪扫描芯片的荧光强度,并将实验结果转换成数值型数据保存,使用专业商用分析软件对原始数据进行分析运算
5. 提供实验报告:包括详细的实验方法和芯片实验数据