高通量BSP测序(NGS-BSP)

产品介绍:

重亚硫酸盐处理结合测序是目前检测甲基化的金标准。在目标区域/位点的甲基化检测和验证环节,我们首次将BSP(Bisulfite Sequencing PCR)和高通量测序技术结合,开发了高通量BSP(NGS-BSP)方法,与传统BSP克隆测序比较,NGS-BSP具有更高的准确性(BMC Genomics.2014,15:716),该方法适合几个到几十个区域/位点进行大规模样本甲基化测序或验证项目,适合所有动物样本、周期快、检测区域/位点灵活、性价比高;NGS-BSP是高效灵活的目标区域甲基化检测的工具。


技术路线:


样本要求:

基因组DNA:>=1ug(20个区域/位点)

样品浓度>30ng/ul;无RNA和蛋白污染。


建库测序:

测序策略:Illumina HiSeq,PE150

测序深度:>100X


标准化分析:

1.原始数据去除低质量、去除接头污染处理

2.测序数据目标区域比对

3.测序数据BS转化率评估

4.目标区域测序深度和覆盖度分析

5.胞嘧啶(C)甲基化水平计算

6.目标区域甲基化水平可视化

7.目标区域甲基化水平分布差异统计

8.多样本间目标区域甲基化水平聚类分析


高级分析:

9.疾病相关甲基化分析和功能预测

10.整合关联分析(需要其他数据,如RT-PCR数据)

11.其他定制化分析


项目周期:

45个工作日

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