产品介绍:
重亚硫酸盐处理结合测序是目前检测甲基化的金标准。在目标区域/位点的甲基化检测和验证环节,我们首次将BSP(Bisulfite Sequencing PCR)和高通量测序技术结合,开发了高通量BSP(NGS-BSP)方法,与传统BSP克隆测序比较,NGS-BSP具有更高的准确性(BMC Genomics.2014,15:716),该方法适合几个到几十个区域/位点进行大规模样本甲基化测序或验证项目,适合所有动物样本、周期快、检测区域/位点灵活、性价比高;NGS-BSP是高效灵活的目标区域甲基化检测的工具。
技术路线:
样本要求:
基因组DNA:>=1ug(20个区域/位点)
样品浓度>30ng/ul;无RNA和蛋白污染。
建库测序:
测序策略:Illumina HiSeq,PE150
测序深度:>100X
标准化分析:
1.原始数据去除低质量、去除接头污染处理
2.测序数据目标区域比对
3.测序数据BS转化率评估
4.目标区域测序深度和覆盖度分析
5.胞嘧啶(C)甲基化水平计算
6.目标区域甲基化水平可视化
7.目标区域甲基化水平分布差异统计
8.多样本间目标区域甲基化水平聚类分析
高级分析:
9.疾病相关甲基化分析和功能预测
10.整合关联分析(需要其他数据,如RT-PCR数据)
11.其他定制化分析
项目周期:
45个工作日