NRGene实力挑战六倍体小麦基因组

　　在刚刚结束的2018中国植物基因组大会上，六倍体小麦基因组组装进展成为科学家们关注的热点。

　　该研究近期于2018年8月17日在线发表在著名的《Science》上，文章以《Shiftingthe limits in wheat research and breeding using a fully annotated referencegenome》为题，报道了六倍体小麦基因组的组装提升，相比于2014年7月发布的草图序列，新的基因组序列由原先的10.2Gb提升到14.5Gb，Scaffold N50提升至22.8Mb。小麦基因组庞大，是典型的异源多倍体基因组，由三套相似而又不同的基因组整合形成一个极为复杂的六倍体基因组，由于其高倍性，加之高度重复序列，给小麦基因组的研究带来巨大的挑战，对六倍体小麦的基因组研究更是延续了13年之久。新的六倍体小麦基因组组装，利用NRGene公司的DeNovoMagic2软件进行短片段组装，结合三维基因组Hi-C技术和高密度遗传图谱（POPSEQ）进行染色体挂载，重新修正了基因组大小为15.4~15.8GB,最终获得1601条super-scaffold,大小为~14.5Gb，可以说是迄今为止完成度最高、质量值最好的小麦基因组序列。

在本次会议报告中，研究团队专门提到了NRGene自主知识产权的DeNovoMAGIC软件。其实这不是NRGene第一次在大型复杂基因组研究中发挥突出贡献，早在2017年7月，由NRGene组装的野生二粒小麦基因组就发表于世界顶级科研杂志《science》，同年11月，NRGene组装的小麦D基因组发表于《Nature》。

此外，NRGene协助完成的高杂和八倍体草莓、杂合四倍体马铃薯、陆地棉、牛及虹鳟鱼等基因组也受到的业界的广泛关注。不难看出NRGene在大型复杂基因组研究中表现非凡。